73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1116 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 330 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0362  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.07 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.025215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4070  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.04 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.951946  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.08 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.44 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4477  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.77 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1548  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.5 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40682  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.57 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  24.47 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.52 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  23.13 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4226  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.13 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0963703  normal  0.823727 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  24.02 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27.18 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4400  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  32.32 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478919  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  23.68 
 
 		 348 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.87 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.81 
 
 		 324 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  23.08 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.51 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.12 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.58 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  20.96 
 
 		 346 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  25.34 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5002  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  32.82 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117483  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.71 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  28.18 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2283  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  27.27 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.95 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0289  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  24.31 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  22.39 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.77 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.81 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  31.25 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  21.05 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  25.7 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4331  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  33.59 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3665  substrate-binding protein involved in ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  25.15 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  20.75 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.18 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  20.75 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  27.03 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  21.24 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3730  ABC transport system substrate-binding protein  26.95 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.13 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1255  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.21 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.113577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.46 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  27.05 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4025  ABC transport system substrate-binding protein  26.95 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 322 aa  43.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  27.69 
 
 		 346 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  34.21 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  19.53 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  17.94 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4101  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.76 
 
 		 317 aa  42.7  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32075  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>