68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 325 aa  659    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  36.36 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  35.22 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  37.24 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  31.95 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  31.56 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  31.67 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1379  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.88 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0275994 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1606  NLPA lipoprotein  25 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.712538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.77 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.18 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  24.05 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  29.55 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.32 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  23.39 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1079  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  32.58 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0298231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.78 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  30.58 
 
 		 339 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.16 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.62 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4593  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.73 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0057  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  28.92 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0403  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  27.66 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6433  ABC transport system substrate-binding protein  29.09 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  25.33 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5927  ABC transport system substrate-binding protein  28.7 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5562  ABC transport system substrate-binding protein  28.7 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  26.85 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.22 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1185  ABC transporter, substrate binding protein  26.11 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.987715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  26.53 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  33.33 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.36 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.7 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.33 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1088  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  28.1 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1800  NLPA lipoprotein  32.54 
 
 		 325 aa  47  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  24.82 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5234  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  30.53 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.08 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.61 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1890  hypothetical protein  23.05 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0206796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  30.09 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3256  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.24 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  20.74 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  30.66 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0425  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  26.72 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.313806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter  28.15 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.553257  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  24.56 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2306  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.76 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2535  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  29.32 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  22.71 
 
 		 406 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2351  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.51 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  20.68 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3730  ABC transport system substrate-binding protein  28.86 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.201225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2186  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.92 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  0.269946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.6 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4025  ABC transport system substrate-binding protein  28.86 
 
 		 336 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  25.61 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.75 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  25.42 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.6 
 
 		 669 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.44 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>