79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1606 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1606  NLPA lipoprotein  100 
 
 
297 aa  597  1e-170  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.712538  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  38.25 
 
 
328 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  34.43 
 
 
315 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  34.97 
 
 
341 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  29.38 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  31.94 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  25.89 
 
 
324 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1379  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.68 
 
 
312 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0275994 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.3 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.95 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.14 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.8 
 
 
347 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1973  NLPA lipoprotein  27.98 
 
 
335 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000524772  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  22.62 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  34.12 
 
 
390 aa  53.9  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  24.23 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.85 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  25.74 
 
 
324 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.92 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.55 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4266  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.42 
 
 
341 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533819  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3062  hypothetical protein  21.13 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1791  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, aliphatic sulfonates family  25.97 
 
 
329 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2802  NLPA lipoprotein  23.78 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000138117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.53 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3748  ABC transporter, substrate binding protein  21.21 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4846  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0183  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.58 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0982  hypothetical protein  21.03 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.51 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  24.07 
 
 
327 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3636  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  35.37 
 
 
401 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal  0.917862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1454  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.74 
 
 
403 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140123  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.39 
 
 
333 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  23 
 
 
327 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2097  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.37 
 
 
401 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34510  hypothetical protein  35.37 
 
 
399 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531773  normal  0.0856491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  25.89 
 
 
477 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 
467 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2276  ABC transporter, periplasmic binding protein  35.37 
 
 
401 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.278656  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2447  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153709 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1715  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.72 
 
 
327 aa  46.2  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  25.27 
 
 
335 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2931  hypothetical protein  34.15 
 
 
399 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0955897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  42.25 
 
 
363 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5823  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  39.08 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437918  normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  22.38 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3603  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.19 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0621  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000550698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  26.19 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.87 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  22.38 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2120  hypothetical protein  20.82 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.79 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3338  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.08 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.09 
 
 
322 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3663  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.17 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.78 
 
 
438 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  24.78 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2838  twin-arginine translocation pathway signal  25.66 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.884222  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  32.5 
 
 
357 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  25.1 
 
 
467 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6336  nitrate/nitrite/cyanate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.37 
 
 
396 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0291  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  23.44 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000806858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.5 
 
 
338 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2750  sulfonate/taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.5 
 
 
340 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4896  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.07 
 
 
346 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  24.39 
 
 
333 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0365  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.05 
 
 
341 aa  42.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.796573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.1 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6513  twin-arginine translocation pathway signal  35.37 
 
 
396 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.47119  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1185  ABC transporter, substrate binding protein  25.61 
 
 
331 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.987715  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6747  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system periplasmic component  35.37 
 
 
396 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.248513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0437  hypothetical protein  22.86 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>