More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0745 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0745  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  100 
 
 
300 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  91.47 
 
 
293 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  85.67 
 
 
293 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  74.48 
 
 
321 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  76.74 
 
 
294 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  75.17 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  74.83 
 
 
292 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  76.74 
 
 
294 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  77.85 
 
 
294 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  74.83 
 
 
293 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  74.48 
 
 
293 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  76.39 
 
 
294 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  76.39 
 
 
294 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  76.39 
 
 
294 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  76.39 
 
 
294 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  75.86 
 
 
293 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  76.21 
 
 
322 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  65.19 
 
 
294 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  65.19 
 
 
326 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  65.75 
 
 
294 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.42 
 
 
295 aa  362  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3459  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.07 
 
 
295 aa  362  6e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171474  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  66.55 
 
 
308 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  64.38 
 
 
295 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  69.96 
 
 
297 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3425  hypothetical protein  66.08 
 
 
297 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3260  hypothetical protein  63.21 
 
 
297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0105382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  55.67 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  54.86 
 
 
299 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  53.82 
 
 
299 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  52.78 
 
 
299 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  52.78 
 
 
299 aa  271  9e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  52.78 
 
 
299 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  52.78 
 
 
299 aa  271  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  52.78 
 
 
299 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.78 
 
 
299 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  52.78 
 
 
299 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  51.53 
 
 
311 aa  268  5.9999999999999995e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  49.13 
 
 
298 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  53.85 
 
 
300 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  53.85 
 
 
299 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  53.85 
 
 
300 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  53.85 
 
 
300 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  53.85 
 
 
299 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3898  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.76 
 
 
300 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  46.13 
 
 
305 aa  225  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42 
 
 
324 aa  225  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  43.02 
 
 
296 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  42.64 
 
 
296 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  45.61 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.27 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  45.65 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  46.96 
 
 
303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  45.61 
 
 
293 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.51 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0661  hypothetical protein  45.05 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 
299 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  43.01 
 
 
298 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  42.75 
 
 
316 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  39.93 
 
 
298 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  41.88 
 
 
298 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  44.22 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  35.35 
 
 
304 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33450  membrane protein  42.16 
 
 
314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4702  hypothetical protein  46.62 
 
 
313 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.41 
 
 
324 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6025  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.9 
 
 
319 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32908  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  39.86 
 
 
307 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2380  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.04 
 
 
324 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3391  membrane protein  39.69 
 
 
300 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.483764  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3679  putative integral membrane protein  42.61 
 
 
301 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.998633  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  42.86 
 
 
310 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1080  hypothetical protein  44.52 
 
 
300 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2539  hypothetical protein  43.77 
 
 
300 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.662204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0075  hypothetical protein  34.29 
 
 
294 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  35.38 
 
 
273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  34.34 
 
 
312 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63190  hypothetical protein  44.67 
 
 
297 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0911  hypothetical protein  35.25 
 
 
303 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  34.65 
 
 
318 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5501  hypothetical protein  46.39 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  34.98 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 
300 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3249  hypothetical protein  32.86 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.538989  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2674  hypothetical protein  37.14 
 
 
301 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  31.19 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  30.8 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  30.74 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.46 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.04 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  29.89 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.27 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.52 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  29.83 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.52 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.52 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.55 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>