More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5341 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5341  ParB family protein  100 
 
 		 569 aa  1157    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0017765  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6529  parB-like partition protein  41.53 
 
 		 555 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5238  parB-like partition protein  40.51 
 
 		 554 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1596  parB-like partition protein  40.51 
 
 		 554 aa  362  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5589  parB-like partition protein  39.55 
 
 		 559 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6241  ParB family protein  40.21 
 
 		 574 aa  335  9e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5020  parB-like partition protein  37.3 
 
 		 591 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4293  parB-like partition proteins  36.44 
 
 		 583 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.407896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  36.46 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5053  ParB family protein  35.35 
 
 		 582 aa  301  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3820  parB-like partition proteins  37.28 
 
 		 564 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.621795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2542  ParB family protein  36.55 
 
 		 587 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.411196 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4412  parB-like partition proteins  33.04 
 
 		 580 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5196  ParB family protein  43.15 
 
 		 549 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.791015 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4308  parB-like partition protein  29.02 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  34.24 
 
 		 286 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5942  parB-like partition protein  36.11 
 
 		 295 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  35.15 
 
 		 274 aa  97.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  36.48 
 
 		 286 aa  97.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  32.29 
 
 		 293 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  32.74 
 
 		 286 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  35.75 
 
 		 315 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  38.12 
 
 		 286 aa  94  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  31.77 
 
 		 293 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  32.98 
 
 		 292 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3554  parB-like partition protein  32.93 
 
 		 281 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  35.11 
 
 		 296 aa  92.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  36.99 
 
 		 311 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  34.25 
 
 		 313 aa  91.3  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  35.06 
 
 		 289 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 283 aa  90.9  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  36.88 
 
 		 305 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0198  parB-like partition protein  39.1 
 
 		 302 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  33.33 
 
 		 306 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  33.94 
 
 		 300 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2643  hypothetical protein  33.52 
 
 		 263 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2513  hypothetical protein  33.52 
 
 		 263 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  36.88 
 
 		 297 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  36.88 
 
 		 297 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  36.88 
 
 		 305 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  36.59 
 
 		 311 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3426  parB-like partition protein  32.78 
 
 		 281 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  36.25 
 
 		 295 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  32.19 
 
 		 272 aa  87.4  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  34.76 
 
 		 313 aa  87  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 286 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 286 aa  87  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  35.67 
 
 		 295 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  33.9 
 
 		 306 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  35.62 
 
 		 295 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  32.22 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  35.09 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  34.68 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  36.47 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.84 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  34.44 
 
 		 287 aa  86.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  32.97 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  33.53 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  36.16 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  32.95 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  34.36 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  35.37 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  34.86 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  28.46 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3483  parB-like partition protein  36.42 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  35.98 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2551  parB-like partition protein  33.92 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00820425  normal  0.388314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  30.91 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2751  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.75 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  31.33 
 
 		 294 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  33.95 
 
 		 257 aa  82.8  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  32.75 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  32 
 
 		 282 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 290 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  33.33 
 
 		 290 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  33.91 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  32.16 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.53 
 
 		 668 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.63 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  32.94 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  34.87 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  35.37 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.14 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  31.19 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2767  parB-like partition proteins  36.91 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000194668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  32 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7332  parB-like partition protein  34.12 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2405  parB-like partition protein  31.61 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.68 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>