More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2936 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2936  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.8 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.08 
 
 		 258 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 279 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.25 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  43.57 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  47.54 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.54 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  46.31 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.3 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  46 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  44.94 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.58 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  44.86 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.01 
 
 		 304 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  41.98 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.03 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  46.19 
 
 		 276 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  46.96 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  46.31 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  42.86 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  46.56 
 
 		 266 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  43.6 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  43.55 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  43.55 
 
 		 265 aa  214  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  43.6 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  43.6 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  43.6 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  44 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.31 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.98 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  43.6 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  44.08 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  40.32 
 
 		 260 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.8 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  43.37 
 
 		 287 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  43.6 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  44.49 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  43.62 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  41.7 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  42.51 
 
 		 285 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.8 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.27 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.67 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  43.09 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  41.39 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.86 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.11 
 
 		 303 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  41.15 
 
 		 276 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  42.21 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  42.21 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  41.13 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  42.51 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  41.37 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.24 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  43.39 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  41.8 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  50.48 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  45.91 
 
 		 311 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.68 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.68 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  42.57 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 434 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 		 438 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.49 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  43.39 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.67 
 
 		 448 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.53 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  43.55 
 
 		 448 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  46.28 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  39.84 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.98 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0876  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.25 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190681  hitchhiker  0.00187528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  39.42 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  42.68 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  42.06 
 
 		 268 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  43.62 
 
 		 249 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  42.51 
 
 		 280 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.42 
 
 		 261 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  41.3 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  42.45 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  43.55 
 
 		 448 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 446 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  41.06 
 
 		 259 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  41.08 
 
 		 303 aa  201  8e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 446 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>