47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2510 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  86.24 
 
 		 109 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  60 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  59.05 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  58.7 
 
 		 102 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  60.49 
 
 		 277 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  59.09 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 113 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  48.35 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  48.81 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  39 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 86 aa  48.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  43.55 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  29.9 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  39.06 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  26.47 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  34.88 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  33.73 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  30.21 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  32.39 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>