More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5929 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  95.91 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  88.37 
 
 		 218 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  80.57 
 
 		 212 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  79.52 
 
 		 212 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  79.9 
 
 		 213 aa  346  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  82.3 
 
 		 213 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  79.15 
 
 		 212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  80.19 
 
 		 213 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  79.05 
 
 		 213 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  81.34 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  81.34 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  81.34 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  81.34 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  81.34 
 
 		 213 aa  331  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  76.17 
 
 		 214 aa  324  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  74.77 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  74.41 
 
 		 212 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  73.46 
 
 		 212 aa  316  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  68.52 
 
 		 217 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  75.71 
 
 		 212 aa  308  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  75.71 
 
 		 212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  56.11 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  53.57 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  53.54 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  49.76 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  50.7 
 
 		 219 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  50.96 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.48 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  52.85 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  49.52 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  50 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  51.81 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  48.34 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  47.83 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  50 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  49.04 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  50 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  41.87 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  41.87 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  46.35 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  44.93 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  44.44 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  45.26 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  44.74 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  44.5 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  45.45 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  39.71 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  42.51 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  41.15 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  41.94 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  43.75 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  43.23 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  40.32 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  40.5 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  43.55 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  43.55 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  41.86 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  37.56 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  38.64 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  36.11 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.02 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.44 
 
 		 264 aa  99.8  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.89 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  31.67 
 
 		 398 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  36.07 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  31.21 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.25 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 		 190 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  28.24 
 
 		 271 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  34.78 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.48 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  34.8 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  33.85 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  27.51 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  36.17 
 
 		 332 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.42 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  29.7 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.95 
 
 		 181 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  31.92 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  29.77 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  29.77 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  29.77 
 
 		 215 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.36 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  29.77 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  29.47 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>