43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5143 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  100 
 
 		 213 aa  407  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  57.75 
 
 		 213 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  59.62 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  54.46 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  55.87 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  56.81 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  51.17 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  52.11 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  52.11 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  45.54 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  55.4 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  48.83 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  55.87 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  41.31 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  43.41 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  43.66 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  43.19 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  46.48 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  45.18 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.27 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  36.79 
 
 		 214 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  35.58 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  33.8 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  36.28 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  36.45 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  37.26 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  33.64 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  38.68 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  30.99 
 
 		 213 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  35.55 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  34.6 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  43.8 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  35.48 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  32.13 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  35.05 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  32.5 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  28.5 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  33.64 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  31.92 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  35.33 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>