37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4623 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4623  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 451 aa  918    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3199  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.930737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1062  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 357 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3496  hypothetical protein  34.16 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280319  normal  0.0769646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  34.13 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2733  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  29.1 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  27.43 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.92 
 
 		 553 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  24.87 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.7 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  23.2 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  45.45 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2603  hypothetical protein  26.56 
 
 		 520 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2602  Flp pilus assembly protein TadG  29.59 
 
 		 500 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  27.14 
 
 		 605 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  26.97 
 
 		 666 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0795  hypothetical protein  40 
 
 		 424 aa  47.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0510548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  28.32 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  34.78 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  24.44 
 
 		 443 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2368  von Willebrand factor, type A  29.86 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0012043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  26.92 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3087  hypothetical protein  52.5 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  31.37 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2962  hypothetical protein  52.5 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0645  hypothetical protein  32.31 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171789  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  27.04 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  26.7 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  26.94 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  26.94 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  28.98 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  24.39 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  38.71 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>