42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7587 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  45.85 
 
 		 891 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 873 aa  1776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  26.93 
 
 		 874 aa  280  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  28.36 
 
 		 869 aa  278  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  28.91 
 
 		 868 aa  271  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  28.48 
 
 		 872 aa  263  8e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  26.75 
 
 		 881 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  28.61 
 
 		 833 aa  228  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  27.22 
 
 		 897 aa  226  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  27.89 
 
 		 895 aa  204  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  27.01 
 
 		 878 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  25.33 
 
 		 896 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  23.51 
 
 		 781 aa  190  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  28.89 
 
 		 880 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  25.57 
 
 		 887 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  25.57 
 
 		 887 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  23.73 
 
 		 869 aa  150  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  24.5 
 
 		 854 aa  137  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  28.96 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  36.7 
 
 		 844 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  37.23 
 
 		 676 aa  55.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  35.88 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  35.48 
 
 		 796 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.92 
 
 		 849 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  27.93 
 
 		 695 aa  48.5  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0032  ABC transporter related  38.81 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.95 
 
 		 734 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  28.47 
 
 		 890 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  38.81 
 
 		 569 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.47 
 
 		 725 aa  46.2  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1474  ABC transporter related  35.62 
 
 		 250 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  37.84 
 
 		 726 aa  45.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  35.34 
 
 		 720 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  32.43 
 
 		 712 aa  45.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 		 375 aa  44.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14231  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 210 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  32.11 
 
 		 500 aa  44.7  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.61 
 
 		 738 aa  44.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  22.84 
 
 		 767 aa  44.3  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  32.61 
 
 		 767 aa  44.3  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  28.57 
 
 		 733 aa  44.3  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22332  predicted protein  29.6 
 
 		 579 aa  44.3  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0126456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>