261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7198 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7198  DNA-3-methyladenine glycosylase I  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717856  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21800  DNA-3-methyladenine glycosylase I  68.72 
 
 		 225 aa  304  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000054024  normal  0.248361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0014  DNA-3-methyladenine glycosylase I  73.6 
 
 		 203 aa  299  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000350265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06520  DNA-3-methyladenine glycosylase I  71.07 
 
 		 211 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.68 
 
 		 202 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000494499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04190  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.97 
 
 		 201 aa  286  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.589142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4228  DNA-3-methyladenine glycosylase I  72.77 
 
 		 201 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07860  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.61 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0687  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.28 
 
 		 263 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1178  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.57 
 
 		 198 aa  218  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00524762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0498  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.6 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.539356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5932  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.89 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402448  decreased coverage  0.00154434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0699  DNA-3-methyladenine glycosylase I  56.77 
 
 		 193 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06360  DNA-3-methyladenine glycosylase I  60.75 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0664  DNA-3-methyladenine glycosylase I  62.03 
 
 		 197 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0108  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.56 
 
 		 197 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1837  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.56 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.34444  normal  0.316002 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0652  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.98 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.920187  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.08 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054596  normal  0.395728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3540  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.11 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3988  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.69 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.138626  decreased coverage  0.000983487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2148  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.38 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177072  hitchhiker  0.0095029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2705  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3019  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.19 
 
 		 191 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4233  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.19 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.358477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3015  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.31 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3007  DNA-3-methyladenine glycosylase I  57.83 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.288496  normal  0.0401678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0781  DNA-3-methyladenine glycosylase I  53.89 
 
 		 192 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4098  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 		 196 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11234  DNA-3-methyladenine glycosylase I tagA  54.64 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127053  normal  0.0780895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4020  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.42 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1255  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.96 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.454095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0153  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.33 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1102  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.01 
 
 		 192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0185  DNA-3-methyladenine glycosidase I  49.22 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0132  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.2 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2189  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.03 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.717911  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0567  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1101  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0055  DNA-3-methyladenine glycosylase I  59.64 
 
 		 194 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1417  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.63 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.53524  normal  0.801121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2374  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.65 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1116  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.96 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.182535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3404  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.47 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0097  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.39 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235254  normal  0.805383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1237  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.35 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4822  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.68 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0147  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  decreased coverage  0.000000114522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4506  DNA-3-methyladenine glycosylase I  55.03 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5808  3-methyladenine-DNA glycosylase  51.67 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0590  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 		 193 aa  174  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.444252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3242  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.48 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0495  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.37 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4003  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.64 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3094  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.28 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4077  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.64 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4332  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.96 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.239227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4052  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.98 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1922  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.98355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0502  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.73 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0319202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4305  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.91 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0448  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 		 232 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.231908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3064  DNA-3-methyladenine glycosylase 1  49.17 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4674  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.37 
 
 		 209 aa  171  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.818815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4216  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.99 
 
 		 186 aa  171  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.779924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0040  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.7 
 
 		 186 aa  171  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0457  DNA-3-methyladenine glycosylase I  49.46 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484982  normal  0.398735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0058  DNA-3-methyladenine glycosylase I  43.72 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2227  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.22 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.62127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04565  DNA-3-methyladenine glycosidase I  47.49 
 
 		 189 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.902141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2154  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.03 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4044  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3749  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0167  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0163  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  168  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2514  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.04 
 
 		 196 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1887  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.51 
 
 		 196 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1795  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.8 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4925  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.571955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1724  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.8 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3870  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  47.19 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03399  3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive  47.19 
 
 		 187 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1181  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.77 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3518  DNA-3-methyladenine glycosylase I  46.96 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104093  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0662  3-methyladenine-DNA glycosylase  51.98 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0359  DNA-3-methyladenine glycosylase I  48.69 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2619  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.19 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0775  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.272148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03350  hypothetical protein  47.19 
 
 		 187 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0555  DNA-3-methyladenine glycosylase I  44.57 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1605  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.6 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0999  DNA-3-methyladenine glycosylase I  58.08 
 
 		 195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142815  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3977  3-methyl-adenine DNA glycosylase I  46.63 
 
 		 187 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0171  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.55 
 
 		 201 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0158  DNA-3-methyladenine glycosylase I  51.55 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.598967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0747  DNA-3-methyladenine glycosylase I  45.95 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.829388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3245  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.86 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3347  DNA-3-methyladenine glycosylase I  52.15 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0810  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.3 
 
 		 192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0581984  hitchhiker  0.00269095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>