241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4862 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4862  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.463107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4748  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  53.57 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.140689  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6340  extracellular solute-binding protein family 3  29.8 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1391  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2454  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0384  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0825987 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.53 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  24.24 
 
 		 727 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.59 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  25.47 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  25.99 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  24.43 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  23.98 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  24.77 
 
 		 714 aa  58.9  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  26.62 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3868  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.04 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4864  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.950459 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  23.58 
 
 		 572 aa  53.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8012  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.37 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.73 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.04 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  23.71 
 
 		 468 aa  52.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.39 
 
 		 513 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4000  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3312  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.159428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.87 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.37 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  24.14 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.71 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.31 
 
 		 320 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.14 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  24.16 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2029  extracellular solute-binding protein family 3  24.37 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00497658  hitchhiker  0.00148627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.54 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  25.33 
 
 		 481 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2170  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.88 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.34 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2344  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.08 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1889  extracellular solute-binding protein family 3  26.32 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1500  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  22.02 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238692  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  27.42 
 
 		 259 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>