179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4601 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4601  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.16736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  64 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  63.67 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  57.57 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2034  hypothetical protein  48.2 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.571695  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1698  hypothetical protein  48.2 
 
 		 358 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.555013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4252  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.71 
 
 		 344 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  40 
 
 		 347 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3441  hypothetical protein  36.21 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.597257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.7 
 
 		 752 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6377  hypothetical protein  23.55 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.498537  normal  0.74546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1167  hypothetical protein  23.26 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0312  hypothetical protein  23.32 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6734  hypothetical protein  24.73 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.745861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  25.75 
 
 		 1094 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.76 
 
 		 354 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.8 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2432  hypothetical protein  27.78 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.750639  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.91 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 		 354 aa  67  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.85 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  25.45 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.26 
 
 		 601 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.23 
 
 		 317 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.23 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6158  hypothetical protein  23.55 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.59 
 
 		 819 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.09 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  26.34 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.33 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7989  NHL repeat containing protein  23.4 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.575818  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.25 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1667 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  32.32 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.22 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.7 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.48 
 
 		 556 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.46 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.88 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.61 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.67 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.41 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  25.73 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.17 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.6 
 
 		 652 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  23.18 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.81 
 
 		 415 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.9 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.82 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.58 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  26.29 
 
 		 426 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.72 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  23.58 
 
 		 343 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.27 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.44 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.31 
 
 		 323 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  31.54 
 
 		 192 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.79 
 
 		 335 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.5 
 
 		 517 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.75 
 
 		 348 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.95 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.92 
 
 		 971 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1253  hypothetical protein  26.84 
 
 		 679 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.337339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.71 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.41 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.05 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.9 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.37 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.79 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.12 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.65 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.1 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.22 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  23.81 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 		 689 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.54 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  25.97 
 
 		 456 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.37 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 		 776 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  29.17 
 
 		 358 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.47 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.17 
 
 		 457 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.86 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24 
 
 		 320 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.58 
 
 		 410 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.16 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  27.5 
 
 		 580 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.18 
 
 		 488 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>