47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1980 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1980  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  336  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.806705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1374  protein of unknown function DUF132  78.52 
 
 		 165 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.854958  hitchhiker  0.00418974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3181  hypothetical protein  86.23 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0366443  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5552  hypothetical protein  75.51 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2248  nucleotide binding protein PINc  76.76 
 
 		 165 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2141  nucleotide binding protein PINc  74.83 
 
 		 165 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.873448  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2262  hypothetical protein  74.83 
 
 		 165 aa  203  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2224  hypothetical protein  76.76 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1612  hypothetical protein  76.76 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1053  hypothetical protein  77.94 
 
 		 165 aa  201  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0032005  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1013  hypothetical protein  52.47 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0977  hypothetical protein  50.97 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0437908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2165  Nucleotide binding protein PINc  53.47 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0440807  normal  0.167197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1841  Nucleotide binding protein PINc  52.78 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147111 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2010  hypothetical protein  52.63 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0775029 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1466  hypothetical protein  79.45 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0148565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1089  hypothetical protein  78.08 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1329  hypothetical protein  78.08 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0443  hypothetical protein  78.08 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0709  hypothetical protein  78.08 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1160  hypothetical protein  78.08 
 
 		 210 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0057059  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1320  hypothetical protein  78.08 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2887  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2605  hypothetical protein  43.88 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.673363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0684  PilT domain-containing protein  40.16 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0474  protein of unknown function DUF132  40.65 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2853  hypothetical protein  39.31 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3449  hypothetical protein  35.06 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0112989  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  36.5 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3712  hypothetical protein  37.06 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0926768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4483  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0423  PilT domain-containing protein  40.8 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0780  hypothetical protein  40.65 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0351  hypothetical protein  35.94 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2114  PilT domain-containing protein  32 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.817585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4252  hypothetical protein  35.59 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0116509  normal  0.0373968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0715  hypothetical protein  30.95 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0340  hypothetical protein  36.55 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.171538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1132  protein of unknown function DUF132  29.27 
 
 		 137 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.986336  normal  0.107749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  30.97 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0319  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000227934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1746  protein of unknown function DUF132  31.9 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  32.17 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  28.19 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  28.33 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>