271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1117 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1117  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  100 
 
 
329 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.949748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5463  hypothetical protein  96.96 
 
 
329 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2172  hypothetical protein  97.26 
 
 
329 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5923  hypothetical protein  97.26 
 
 
329 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2154  hypothetical protein  97.26 
 
 
329 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.305615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2191  hypothetical protein  96.35 
 
 
329 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2064  hypothetical protein  96.05 
 
 
329 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1749  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1529  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.435429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2775  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  90 
 
 
330 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2258  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3062  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0002291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2696  hypothetical protein  87.58 
 
 
330 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0538504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2640  hypothetical protein  87.27 
 
 
330 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388578  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2620  hypothetical protein  76.11 
 
 
339 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0272263  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1516  hypothetical protein  81.15 
 
 
339 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610036  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1486  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  79.42 
 
 
337 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  64.63 
 
 
328 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  66.45 
 
 
330 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2064  putative signal peptide protein  62.7 
 
 
339 aa  421  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1080  cytochrome d1 heme region  65.2 
 
 
331 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.952849  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1172  cytochrome d1 heme region  64.86 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  58.36 
 
 
345 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  59.26 
 
 
299 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1802  hypothetical protein  49.19 
 
 
339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000263268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  51.18 
 
 
335 aa  281  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2081  hypothetical protein  50.5 
 
 
313 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  48.29 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  46.98 
 
 
306 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.86 
 
 
341 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  47.6 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  45.64 
 
 
345 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.86 
 
 
410 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  43.67 
 
 
333 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  39.94 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.87 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.35 
 
 
384 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.15 
 
 
366 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0826  hypothetical protein  30.77 
 
 
445 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0133679 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  32.24 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.9 
 
 
317 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1613  hypothetical protein  28.95 
 
 
426 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144608  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.25 
 
 
348 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.25 
 
 
348 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.1 
 
 
362 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  28.75 
 
 
433 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0163  hypothetical protein  28.53 
 
 
456 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.12 
 
 
347 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.11 
 
 
324 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.47 
 
 
362 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.14 
 
 
348 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0690  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.81 
 
 
318 aa  95.9  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0314651  normal  0.511949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.33 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
340 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.52 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.06 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  27.97 
 
 
971 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.11 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.65 
 
 
1667 aa  94  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.08 
 
 
556 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.03 
 
 
517 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.07 
 
 
330 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.87 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.43 
 
 
689 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  25 
 
 
580 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.13 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.58 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.01 
 
 
336 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.6 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  27.87 
 
 
329 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.16 
 
 
310 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.39 
 
 
417 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.56 
 
 
1094 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.03 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.97 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7977  hypothetical protein  26.18 
 
 
497 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37687  normal  0.148037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.63 
 
 
384 aa  87.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.71 
 
 
329 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.43 
 
 
334 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  26.61 
 
 
391 aa  86.7  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.67 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.38 
 
 
328 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.39 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.89 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.96 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.82 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.66 
 
 
387 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.35 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2182  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.08 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.361947 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.65 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.64 
 
 
457 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  24.67 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.63 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>