108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2813 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2813  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.233538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1087  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.55 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1162  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  42.19 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4425  Arginase/agmatinase/formimionoglutamate hydrolase arginase family-like protein  36.26 
 
 		 477 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5626  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  35.58 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  decreased coverage  0.00341242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5820  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.35 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884227  normal  0.0129098 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78364  arginase  32.3 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.11842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0153  arginase  33.62 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000739593  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2557  arginase  27.31 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.579641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  28.43 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0850  arginase  29.67 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2196  arginase  28.65 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2234  arginase  28.65 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0147  arginase  28.67 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000771813  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38509  predicted protein  31.29 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.332292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0186  arginase  27.97 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5138  arginase  27.97 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.450482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2324  arginase  30.86 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0148  arginase  27.97 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1886  arginase  27.96 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00550  arginase, putative  27.27 
 
 		 398 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0155  arginase  29.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0149  arginase  29.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.454537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0147  arginase  29.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.148102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0154  arginase  29.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0177  arginase  29.37 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0149  arginase  30.17 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0154  arginase  28.67 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2852  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.44 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0198  arginase  28.67 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0321  arginase  29.67 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09260  arginase family hydrolase, arginase/agmainase/formiminoglutamate hydrolase  29.53 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4137  arginase  31.79 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  30.92 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1433  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.21 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0455111  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0544  arginase  34.42 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.651967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0479  arginase  34.42 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5460  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.34 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.044895  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3629  arginase  27.55 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1461  arginase  26.41 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.229743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0236  arginase  27.03 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0515  arginase  32.47 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.299985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3917  arginase  27.84 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.96346 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02901  Arginase (EC 3.5.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12611]  27.43 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.332613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  26.54 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0681  arginase  28.14 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2733  arginase  27.37 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.859323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  26.32 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4596  arginase  32.89 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2470  arginase  29.21 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.014347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0158  arginase  25.22 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.833634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1270  arginase  30.57 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0652198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  23.83 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4687  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.65 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6292  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.35 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1081  arginase  28.21 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.27579 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0934  arginase  29.12 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.016664  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02850  arginase  24.88 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  25.96 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3772  arginase  24.17 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2891  arginase  29.41 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0907  arginase  28.11 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.160766  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1794  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  21.76 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.646528  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1051  arginase  28.18 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0238  arginase  25.93 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1543  arginase  27.46 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0809  arginase  26.42 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  26.13 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0842  arginase  33.88 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2098  arginase  26.07 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  22.65 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  26.13 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1712  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.47 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  27.63 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0755  arginase  24.18 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  25.21 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1926  Arginase/agmatinase/formimino glutamase  25.22 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5210  arginase  32.79 
 
 		 327 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2319  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  20.99 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.239055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5811  arginase  28.93 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.309754  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  26.07 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5977  arginase  29.41 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1073  arginase  28.47 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2266  arginase  29.93 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0048  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.63 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2929  arginase  29.94 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2468  arginase  28.4 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.496272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0950  arginase  31.15 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3926  arginase  24.53 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000076014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1242  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.95 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0051  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.65 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.535245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3637  arginase  26.83 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0654  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.04 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2309  arginase  29.61 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.567665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3963  arginase  32.61 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  25.89 
 
 		 307 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1825  arginase  27.15 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2768  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  24.88 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  22.44 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3606  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.86 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0938214 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>