More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0853 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0853  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 479 aa  957    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  59.2 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  44.66 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1848  cation diffusion facilitator family transporter  44.37 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  42.64 
 
 		 478 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1450  cation diffusion facilitator family transporter  41.1 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25137  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2149  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 460 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3095  putative cation-efflux pump  40.74 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1201  cation efflux protein  40.79 
 
 		 460 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  34.42 
 
 		 460 aa  282  9e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2530  cation diffusion facilitator family transporter  34.59 
 
 		 460 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  34.93 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  34.15 
 
 		 459 aa  259  8e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  32.68 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  33.97 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1202  cation diffusion facilitator family transporter  30.67 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0622136  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  27.12 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0332  cation diffusion facilitator family transporter  26.09 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  31.38 
 
 		 328 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  29.08 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  31.46 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2008  cation efflux family protein  29.55 
 
 		 293 aa  117  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.536733  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  28.83 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  29.72 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  29.25 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  31.78 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 307 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  30.38 
 
 		 311 aa  114  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3356  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2576  cation diffusion facilitator family transporter  32.64 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102277 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04060  cation diffusion facilitator family transporter  26.04 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  28.12 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  28.57 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1549  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3009  cation diffusion facilitator family transporter  29.33 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3537  cation diffusion facilitator family transporter  27.11 
 
 		 294 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  29.76 
 
 		 389 aa  111  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  28.37 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  27.76 
 
 		 300 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  30.52 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  26.23 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  28.82 
 
 		 317 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 		 311 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1774  cation diffusion facilitator family transporter  29.34 
 
 		 293 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000103729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4475  cation efflux family protein  29.35 
 
 		 296 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  28.18 
 
 		 289 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 300 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2491  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  26.96 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0719  cation diffusion facilitator family transporter  29.77 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0858  cation efflux protein  27.86 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2443  cation diffusion facilitator family transporter  29.7 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4808  ferrous iron efflux protein F  28.04 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  27.47 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  28.36 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  27.74 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  28.42 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  29.39 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  28.36 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  28.32 
 
 		 307 aa  107  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0936  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1177  cation diffusion facilitator family transporter  28.93 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0088  ferrous iron efflux protein F  28 
 
 		 300 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  28.34 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0314  cation diffusion facilitator family transporter  28.67 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000499164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  30.53 
 
 		 295 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0263  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000665998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  27.08 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0258  cation diffusion facilitator family transporter  30.36 
 
 		 296 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0238617  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  30.5 
 
 		 285 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  25.28 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0369  cation diffusion facilitator family transporter  29.29 
 
 		 293 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000868845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  30.43 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3077  hypothetical protein  29.75 
 
 		 392 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  27.82 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  29.18 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0702  Co/Zn/Cd cation transporter  27.92 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1144  cation efflux family protein  28.92 
 
 		 289 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0182712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3245  cation efflux protein  28.77 
 
 		 309 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0256  cation diffusion facilitator family transporter  30.25 
 
 		 290 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.015822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  29.64 
 
 		 289 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0983  cation efflux family protein  28.92 
 
 		 289 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0179207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0254  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 297 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00100286  hitchhiker  0.000434478 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3767  cation diffusion facilitator family transporter  28.01 
 
 		 297 aa  103  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0281724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>