More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31960 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31960  conserved hypothetical protein TIGR00278  100 
 
 
95 aa  188  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5413  protein of unknown function DUF37  55.13 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  47.06 
 
 
85 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  59.46 
 
 
107 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  54.41 
 
 
75 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  54.41 
 
 
78 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.7 
 
 
69 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 
70 aa  84.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  59.7 
 
 
105 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.94 
 
 
78 aa  83.6  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  55.88 
 
 
70 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  49.35 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0218  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  60.66 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  52.17 
 
 
77 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  48.72 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2336  protein of unknown function DUF37  47.3 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.230771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  57.35 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  52.94 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  50 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4241  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
74 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0222138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0582  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4386  hypothetical protein  53.62 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2777  hypothetical protein  49.25 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  48.68 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  51.61 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4223  protein of unknown function DUF37  51.25 
 
 
115 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.641679  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3377  protein of unknown function DUF37  51.28 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.73 
 
 
92 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  47.5 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2995  hypothetical protein  47.76 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000187379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  47.76 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  47.06 
 
 
85 aa  77  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  46.75 
 
 
95 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  52.11 
 
 
98 aa  77  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  52.94 
 
 
98 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  55.88 
 
 
74 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  53.73 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5013  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  51.47 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  50.7 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  52.24 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4141  hypothetical protein  52.94 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  57.58 
 
 
73 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  46.75 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0140  hypothetical protein  45.07 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9054  protein of unknown function DUF37  48.57 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00509296  normal  0.587556 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14190  conserved hypothetical protein TIGR00278  43.59 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  55.88 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  51.47 
 
 
90 aa  75.9  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  51.47 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4114  hypothetical protein  45.65 
 
 
105 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.049337  normal  0.0907905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  38.82 
 
 
92 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  52.24 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  53.73 
 
 
70 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4697  hypothetical protein  48.53 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.326842  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  54.41 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  54.1 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1039  hypothetical protein  47.83 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000855466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  52.46 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  46.91 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  46.91 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  52.46 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  52.46 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  52.46 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  50.7 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  50 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  45.68 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  53.45 
 
 
73 aa  73.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  46.38 
 
 
96 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  49.18 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  48.65 
 
 
91 aa  73.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0311  hypothetical protein  52.05 
 
 
86 aa  73.6  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  50.82 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  47.78 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  47.3 
 
 
131 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>