219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31070 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31070  cation/cationic drug transporter  100 
 
 		 106 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.438868  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3345  small multidrug resistance protein  59.43 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0912633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2988  small multidrug resistance protein  53.7 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3553  small multidrug resistance protein  53.77 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2987  small multidrug resistance protein  55 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.112994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4976  small multidrug resistance protein  49.52 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0616597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12490  cation/cationic drug transporter  50.48 
 
 		 106 aa  84  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4527  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.380277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31080  cation/cationic drug transporter  56 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234075  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38630  cation/cationic drug transporter  45.71 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2867  small multidrug resistance protein  52.22 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2911  small multidrug resistance protein  52.22 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2897  small multidrug resistance protein  52.22 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216047  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3554  small multidrug resistance protein  50.53 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.307577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3346  small multidrug resistance protein  49.53 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0550769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0987  small multidrug resistance efflux protein  45.79 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2866  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0627  small multidrug resistance protein  45.79 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2910  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2896  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6952  small multidrug resistance protein  44.86 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1884  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3228  multidrug efflux protein  42 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0308245  hitchhiker  0.000780201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0437  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.453624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1762  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1603  multidrug efflux protein  41 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352426 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0813  multidrug efflux protein  41 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.109831  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2036  multidrug efflux protein  41 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0798  SMR family multidrug efflux transporter  43.75 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.621925  normal  0.0234862 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00493  multidrug efflux protein  41 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2428  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0107845  hitchhiker  0.000083233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1319  small multidrug resistance protein  47.66 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0145783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00498  hypothetical protein  41 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2802  multidrug resistance protein, SMR family  39.42 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2779  multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0271  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06909  hypothetical protein  38.14 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0802  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.27 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0657  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5038  small multidrug resistance protein  45.1 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0352813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2603  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1914  small multidrug resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0828  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.251219  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1804  multidrug resistance protein, SMR family protein  41.75 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1234  small multidrug resistance protein  45.26 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2208  quaternary ammonium compound-resistance protein  41.75 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.831863  normal  0.342211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1481  small multidrug resistance protein  44.21 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4225  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.023296 
 
 
-
 
NC_004310  BR0928  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.117588  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0159  multidrug efflux transporter  40.95 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0763675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0377  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2259  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1460  small multidrug resistance protein  44.21 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4478  quaternary ammonium compound-resistance protein  44.04 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513  normal  0.735408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0921  quaternary ammonium compound-resistance protein  43.75 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476665  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2410  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3425  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1245  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1984  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1730  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0388  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1815  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.701999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1832  quaternary ammonium compound-resistance protein QacE  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.935098  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0774  SMR family multidrug efflux pump  43.16 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0072  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.271794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1911  multidrug efflux system protein MdtJ  39.22 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1659  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119593  normal  0.110471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1673  small multidrug resistance protein  43.16 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3259  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.318162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2364  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0339  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2543  small multidrug resistance protein  43 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544067  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0450  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.724767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2072  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1670  small multidrug resistance protein  41.51 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.774613  hitchhiker  0.00381818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4701  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3466  small multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2205  small multidrug resistance protein  44 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4975  small multidrug resistance protein  48.15 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0590431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0731  small multidrug efflux pump  35.71 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2787  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0231795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1236  small multidrug resistance protein  37.86 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1079  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1559  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1826  small multidrug resistance protein  40.62 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1061  small multidrug resistance protein  43.64 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596528  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1535  small multidrug resistance protein  42.11 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3008  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3102  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0883  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.034297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1027  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.927874  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2502  quaternary ammonium efflux pump, 4 TMS small multidrug resistance (SMR) family, GacE  41 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85484  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1196  small multidrug resistance protein  35.05 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2257  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.709004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1437  small multidrug resistance protein  34.26 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1617  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2505  SMR family multidrug efflux pump  41.05 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4263  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0118  small multidrug resistance protein  40.95 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3009  small multidrug resistance protein  42.31 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>