72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3111 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  338  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  50 
 
 
136 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  40 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2785  nucleoside triphosphatase YtkD  43.33 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
131 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
164 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1880  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.873676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1844  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  32.97 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  36.51 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
133 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1908  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  36.51 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.97 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2041  8-oxo-dGTPase  26.87 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  32.97 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  32.97 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1355  MutT/nudix family protein  28.81 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.099509  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
102 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
140 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  30.11 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  28.32 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
282 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3038  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
140 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  25 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.66 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  41.3 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 
131 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  50 
 
 
129 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  32.67 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  31.52 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  32.05 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  48.48 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
168 aa  40.8  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
137 aa  40.8  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  40 
 
 
137 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  36.89 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  44 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>