83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1355 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1355  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 158 aa  327  3e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.099509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1844  hypothetical protein  58.06 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1880  hypothetical protein  58.06 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.873676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  35.22 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  35.22 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  35.22 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  35.22 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  35.22 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2785  nucleoside triphosphatase YtkD  36.67 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  35.26 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  35.26 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  35.22 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  35.22 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  35.22 
 
 		 159 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  35.48 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0588  nucleoside triphosphatase YtkD  37.42 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1148  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 369 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.42 
 
 		 314 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 193 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.88 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  27.72 
 
 		 139 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 181 aa  43.9  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2628  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.130048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  36.11 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  38.89 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  38.89 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  28.81 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1451  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  25.41 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  24.73 
 
 		 153 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 360 aa  42.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  24.73 
 
 		 153 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  24.73 
 
 		 153 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  23.94 
 
 		 196 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  52.78 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0468  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  27.27 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 194 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.82 
 
 		 196 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.18 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1314  NUDIX family hydrolase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.861294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1305  NUDIX family hydrolase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1145  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107087  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1814  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0428  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  24.73 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  41.07 
 
 		 132 aa  41.2  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40 
 
 		 316 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.25 
 
 		 131 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.38 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  44.9 
 
 		 360 aa  40.8  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  25.4 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  39.66 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  25.4 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  24.73 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  25.66 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  41.07 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 196 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 195 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 360 aa  40.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>