43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0952 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  100 
 
 
163 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  97.55 
 
 
163 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  97.55 
 
 
163 aa  288  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  88.96 
 
 
163 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  82.21 
 
 
343 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  76.69 
 
 
167 aa  231  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  80.99 
 
 
142 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  65.33 
 
 
178 aa  187  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  65.96 
 
 
180 aa  184  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  59.48 
 
 
170 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  54.94 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  57.97 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  57.97 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  57.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  57.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  57.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  57.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  57.25 
 
 
164 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  29.63 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  46.77 
 
 
267 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  46.77 
 
 
267 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  43.08 
 
 
269 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  45.45 
 
 
354 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  40.62 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  42.37 
 
 
263 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  43.75 
 
 
495 aa  44.7  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  52.5 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.26 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  32.26 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  28.7 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  33.33 
 
 
248 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  44.68 
 
 
291 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  37.5 
 
 
411 aa  41.6  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 
267 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  39.29 
 
 
267 aa  41.2  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  39.29 
 
 
267 aa  41.2  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  33.87 
 
 
244 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  46.67 
 
 
451 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  45.65 
 
 
266 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  40 
 
 
258 aa  40.8  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  43.48 
 
 
279 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  41.3 
 
 
265 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>