More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3293 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0838  amino acid permease  90.56 
 
 		 551 aa  1003    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5970  amino acid permease-associated region  63.62 
 
 		 546 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699386  normal  0.10331 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0996  amino acid permease  90.56 
 
 		 551 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858254  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0481  putative amino acid transporter  90.56 
 
 		 551 aa  1004    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.483178  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4239  amino acid permease-associated region  91.99 
 
 		 551 aa  1022    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3293  amino acid permease-associated region  77.86 
 
 		 555 aa  872    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3557  amino acid permease-associated region  96.01 
 
 		 551 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5831  amino acid permease-associated region  70.77 
 
 		 545 aa  752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2118  hypothetical protein  90.74 
 
 		 551 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.755576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0581  amino acid transporter  97.64 
 
 		 551 aa  1095    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0750  amino acid permease  90.74 
 
 		 551 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1858  amino acid transporter, putative  91.11 
 
 		 551 aa  1016    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.540964  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5075  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 551 aa  1113    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5210  amino acid permease-associated region  99.27 
 
 		 551 aa  1109    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1969  amino acid permease  90.56 
 
 		 551 aa  1004    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5012  amino acid permease-associated region  97.82 
 
 		 551 aa  1095    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3293  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 551 aa  1113    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0700  amino acid permease  90.56 
 
 		 551 aa  1004    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4487  amino acid permease-associated region  97.1 
 
 		 551 aa  1088    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3183  amino acid permease-associated region  56.03 
 
 		 560 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.577712  normal  0.0276792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5964  amino acid permease-associated region  55.96 
 
 		 559 aa  621  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0671695 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0446  amino acid permease-associated region  54.8 
 
 		 562 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000198962  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0922  amino acid permease-associated region  47.57 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3606  amino acid permease-associated region  48.89 
 
 		 571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3317  amino acid permease-associated region  47.13 
 
 		 594 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6593  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000438666 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5657  amino acid permease-associated region  46.51 
 
 		 594 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0675998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23200  amino acid transporter  38.85 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3606  amino acid permease  29.19 
 
 		 508 aa  173  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.582205 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2292  amino acid transporter  30.23 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5040  Amino acid transporter-like protein  27.19 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973812  normal  0.0393734 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  27.07 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 516 aa  76.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0198  amino acid permease-associated region  27.84 
 
 		 490 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000143228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  25.32 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5443  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.863947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  23.38 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  23.17 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4164  amino acid permease-associated region  27.37 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.696427  normal  0.49431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  22.64 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 486 aa  67  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  24.73 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1191  amino acid permease-associated region  25.05 
 
 		 499 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  23.26 
 
 		 499 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4722  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  21.52 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  25.48 
 
 		 538 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  25.38 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  23.21 
 
 		 503 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  20.91 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  22.5 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  22.96 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  23.01 
 
 		 530 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  24.62 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  22.9 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1740  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327226  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  22.29 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1820  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 		 486 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  22.82 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  22.29 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  22.29 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  24.04 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  23.18 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  23.66 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0596  ethanolamine transproter  22.48 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  24.42 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  22.07 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  26.46 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  24.63 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0097  amino acid transporter  25.5 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000513472  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0554  amino acid transporter  26.23 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00163593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0544  ethanolamine transproter  22.16 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  24.68 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  24.68 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0583  ethanolamine transproter  22.16 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  24.68 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  24.68 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  24.37 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0589  ethanolamine transproter  22.16 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360598  normal  0.279879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.99 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1332  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.454402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1368  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1349  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 		 490 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.923637  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  24.78 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.81 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>