48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4199 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 1278 aa  2538    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.44 
 
 		 347 aa  132  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.45 
 
 		 376 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.16 
 
 		 340 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.32 
 
 		 628 aa  97.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.27 
 
 		 466 aa  95.9  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.33 
 
 		 316 aa  95.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.29 
 
 		 517 aa  92.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.13 
 
 		 350 aa  92.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  30.43 
 
 		 341 aa  91.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  26.75 
 
 		 607 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 634 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 634 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 634 aa  90.9  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.13 
 
 		 355 aa  90.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  30.38 
 
 		 340 aa  89.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  25.32 
 
 		 344 aa  89.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  26.86 
 
 		 627 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 		 507 aa  89  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.95 
 
 		 316 aa  87  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.24 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  28.66 
 
 		 2073 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 355 aa  84.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.96 
 
 		 316 aa  83.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.26 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.64 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.32 
 
 		 316 aa  81.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  25.32 
 
 		 316 aa  81.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  24.84 
 
 		 316 aa  79.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.27 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  24.27 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.47 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.69 
 
 		 362 aa  74.3  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  25.47 
 
 		 502 aa  70.1  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.63 
 
 		 378 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.5 
 
 		 315 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.6 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  23.53 
 
 		 377 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.48 
 
 		 315 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  23.74 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.74 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.74 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  24.83 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.94 
 
 		 505 aa  61.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  26.19 
 
 		 384 aa  51.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 		 315 aa  50.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>