176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4123 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  100 
 
 		 572 aa  1134    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  58.92 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  64.82 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  63.18 
 
 		 469 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  30.5 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  39.46 
 
 		 408 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  41.35 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  30 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4933  HNH nuclease  41.04 
 
 		 407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  40.72 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  28.77 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  28.54 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  28.54 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  28.1 
 
 		 552 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  31.52 
 
 		 414 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  28.91 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  28.07 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  32.6 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  30.24 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  32.97 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.87 
 
 		 540 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  33.1 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  27.21 
 
 		 501 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  27.54 
 
 		 451 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  26.67 
 
 		 507 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  26.9 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  26.9 
 
 		 519 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  27.69 
 
 		 444 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  32.6 
 
 		 437 aa  95.5  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  27.69 
 
 		 444 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  27.21 
 
 		 506 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  27.69 
 
 		 444 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09510  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 464 aa  94  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531982  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  26.43 
 
 		 507 aa  94  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  27.36 
 
 		 447 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  27.69 
 
 		 448 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  27.87 
 
 		 518 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  27.04 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  27.04 
 
 		 492 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  27.18 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  27.18 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  40.17 
 
 		 620 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7882  HNH endonuclease  34.81 
 
 		 391 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00294777  hitchhiker  0.00944768 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  41.03 
 
 		 505 aa  88.6  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  27.69 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  27.04 
 
 		 492 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  27.04 
 
 		 492 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1280  HNH nuclease  36.76 
 
 		 414 aa  87.4  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  28.19 
 
 		 513 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  27.04 
 
 		 490 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  27.04 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3314  hypothetical protein  39.67 
 
 		 526 aa  87.4  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0608226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  27.04 
 
 		 473 aa  87  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  27.69 
 
 		 448 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  26.38 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  26.73 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01520  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 504 aa  83.2  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  41.01 
 
 		 580 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2809  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.46978  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0183  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  28.78 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2273  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.538872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  37.93 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  30.84 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18050  hypothetical protein  28.43 
 
 		 577 aa  81.6  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418777  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.42 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1896  HNH endonuclease  34.16 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  41.48 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.57 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23120  hypothetical protein  34.62 
 
 		 522 aa  76.6  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0151991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  41.59 
 
 		 441 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  38.69 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26200  hypothetical protein  27.02 
 
 		 526 aa  75.5  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01940  hypothetical protein  36.76 
 
 		 524 aa  74.3  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  32.9 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0067  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 628 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  40.95 
 
 		 551 aa  72  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  29.95 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.65 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26470  hypothetical protein  47.37 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.231742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0483  hypothetical protein  27.42 
 
 		 633 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  35.2 
 
 		 508 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  24.44 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01610  hypothetical protein  34.65 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.746521  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  27.65 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 620 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21450  hypothetical protein  38.32 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000664219  hitchhiker  0.0000176037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>