28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0483 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0483  hypothetical protein  100 
 
 
633 aa  1241    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  43.58 
 
 
546 aa  212  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  44.41 
 
 
561 aa  210  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  30.49 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  30 
 
 
627 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  36.78 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  37.04 
 
 
661 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  29.68 
 
 
451 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  33.33 
 
 
492 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  31.25 
 
 
444 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  31.25 
 
 
444 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  30 
 
 
508 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  28.66 
 
 
489 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  31.43 
 
 
508 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  27.27 
 
 
442 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  27.27 
 
 
442 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  31.76 
 
 
492 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  27.93 
 
 
447 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  29.55 
 
 
444 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  31.76 
 
 
492 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  33.12 
 
 
442 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  27.27 
 
 
490 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  29.82 
 
 
473 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  29.82 
 
 
473 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  29.61 
 
 
448 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  30.41 
 
 
493 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  29.61 
 
 
448 aa  44.3  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>