56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3175 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3175  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 910 aa  1734    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.612521  normal  0.0435773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0699  protein of unknown function DUF214  37.73 
 
 		 934 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4158  protein of unknown function DUF214  32.58 
 
 		 934 aa  257  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.434869  normal  0.0912085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  31.51 
 
 		 926 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4811  protein of unknown function DUF214  31.18 
 
 		 998 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.661642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8050  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  32.08 
 
 		 852 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3549  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 		 881 aa  161  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8049  hypothetical protein  33.6 
 
 		 891 aa  117  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0830  protein of unknown function DUF214  34.97 
 
 		 958 aa  116  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.800045 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06210  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.96 
 
 		 933 aa  87.4  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 878 aa  76.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.89 
 
 		 857 aa  67  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.57 
 
 		 858 aa  62  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  22.36 
 
 		 856 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 838 aa  60.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 855 aa  58.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  29.93 
 
 		 779 aa  57.4  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.57 
 
 		 835 aa  55.1  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  26.56 
 
 		 885 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 		 848 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.78 
 
 		 664 aa  53.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.36 
 
 		 863 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.13 
 
 		 1090 aa  52  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.09 
 
 		 408 aa  50.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  22.54 
 
 		 643 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  33.59 
 
 		 656 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 871 aa  49.7  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.22 
 
 		 897 aa  48.9  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 846 aa  48.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  35.34 
 
 		 402 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 386 aa  48.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.69 
 
 		 854 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.31 
 
 		 930 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  27.13 
 
 		 653 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  33.96 
 
 		 841 aa  47.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 855 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 849 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  27.44 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.89 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.36 
 
 		 662 aa  47  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  22.37 
 
 		 646 aa  47  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.25 
 
 		 657 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  29.69 
 
 		 654 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 		 452 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.35 
 
 		 411 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  27.91 
 
 		 648 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  27.91 
 
 		 648 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  30.23 
 
 		 647 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 400 aa  45.4  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  24.44 
 
 		 651 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 443 aa  45.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.53 
 
 		 389 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.23 
 
 		 656 aa  45.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 		 849 aa  44.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  33.08 
 
 		 850 aa  44.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.23 
 
 		 656 aa  44.3  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>