More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1295 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1295  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 345 aa  689    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3452  transcriptional regulator, LacI family  42.57 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2723  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.858464 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3390  hypothetical protein  34.81 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.305361  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2515  transcriptional regulator, LacI family  38.15 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185479  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3098  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.1 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3382  transcriptional regulator, LacI family  39.08 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.22035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4981  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00303517  hitchhiker  0.00602163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 353 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.79 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2822  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  28.44 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  30.63 
 
 		 384 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  30.2 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  26.84 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01891  putative sugar-binding protein  29.31 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0103851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  30.12 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.73 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1631  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 381 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.213128  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0786  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1093  LacI family transcription regulator  30.33 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  25.38 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  29.83 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  29.57 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3140  transcriptional regulator, LacI family  29.81 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.636128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2753  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.38 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1655  LacI family transcription regulator  29.43 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.677065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  30.42 
 
 		 376 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.31 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4706  transcriptional regulator, LacI family  26.1 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07090  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.72012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1965  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 332 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  25.23 
 
 		 337 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1802  LacI family transcription regulator  27.61 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  29.49 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01297  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2326  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000810119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  30.69 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2305  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00729932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1553  transcriptional regulator, LacI family  27.44 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01308  hypothetical protein  27.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0638482  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1435  LacI family transcription regulator  27.44 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3563  gluconate utilization system GNT-I transcriptional repressor  28.53 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  25.23 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.41 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1531  LacI family transcription regulator  27.13 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  22.46 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  24.25 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.68 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  31.25 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  25.68 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  29.85 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  24.69 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  25.45 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  25.68 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  27.66 
 
 		 333 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  23.81 
 
 		 336 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  28.61 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.32 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  28.84 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.84 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  25.15 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  24.7 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  24.7 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  25 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  25.15 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  25.15 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3453  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.364896  normal  0.286826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.51 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0485  transcriptional repressor, LacI family  30.23 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3336  LacI transcriptional regulator  28.45 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00746988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  25.23 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  29.38 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  30.25 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1772  transcriptional regulator, LacI family protein  29.53 
 
 		 345 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.297999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0593  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0226  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.586057  normal  0.327461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  27.33 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  27.49 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1887  LacI family transcription regulator  29.61 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.587669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2155  LacI family transcription regulator  25.61 
 
 		 336 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>