More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1098 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1098  ABC transporter related  100 
 
 
421 aa  845    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.894921  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0963  ABC transporter related protein  74.22 
 
 
431 aa  624  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507852  hitchhiker  0.00012031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1116  ABC transporter related  72.92 
 
 
418 aa  610  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.570799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  64.69 
 
 
425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  71.21 
 
 
409 aa  560  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  70.54 
 
 
399 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20460  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  66.35 
 
 
436 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.511444  normal  0.216317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  62.85 
 
 
430 aa  487  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  57.14 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.38 
 
 
393 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  55.75 
 
 
389 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  56.09 
 
 
398 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  53 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  54.02 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  53 
 
 
405 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  52.55 
 
 
386 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  53.57 
 
 
405 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  52.94 
 
 
393 aa  395  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4647  ABC transporter related protein  52.2 
 
 
388 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 
391 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  54.92 
 
 
368 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  52.17 
 
 
387 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  53.03 
 
 
406 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3987  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
368 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125928  normal  0.808718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  47.97 
 
 
398 aa  358  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  49.39 
 
 
426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  47.72 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  50.39 
 
 
382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  50.65 
 
 
381 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.84 
 
 
370 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.31 
 
 
370 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.59 
 
 
374 aa  348  9e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  51.55 
 
 
380 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  53.29 
 
 
376 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.03 
 
 
372 aa  346  3e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  50.13 
 
 
408 aa  346  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.27 
 
 
369 aa  346  5e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  50.37 
 
 
410 aa  345  6e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  47.33 
 
 
370 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  46.57 
 
 
385 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
369 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.32 
 
 
366 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  47.59 
 
 
372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.58 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  47.95 
 
 
370 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 
366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  46.58 
 
 
384 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.71 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  50.25 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  49.74 
 
 
388 aa  342  7e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  49.12 
 
 
405 aa  342  8e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  45.74 
 
 
365 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  48.07 
 
 
375 aa  341  1e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  45.74 
 
 
365 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  49.22 
 
 
365 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
366 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
366 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.79 
 
 
367 aa  340  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  50.65 
 
 
380 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
360 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
366 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
360 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  45.69 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  45.69 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  45.69 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
366 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.69 
 
 
360 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.8 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.83 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.83 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 
360 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.94 
 
 
377 aa  335  5.999999999999999e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  46.13 
 
 
373 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
364 aa  335  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  47.04 
 
 
367 aa  335  7e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  47.04 
 
 
367 aa  335  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
395 aa  334  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50.39 
 
 
360 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  50.26 
 
 
362 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
374 aa  333  4e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.09 
 
 
366 aa  333  5e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
406 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  46.97 
 
 
372 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  49.55 
 
 
367 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
366 aa  332  8e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  48.72 
 
 
371 aa  332  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
366 aa  332  8e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  49.75 
 
 
404 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
398 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  50.13 
 
 
364 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  51.01 
 
 
378 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 
381 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>