74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0501 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  72.27 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  71.04 
 
 		 268 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  67.46 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  54.55 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  53.18 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  49.38 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  50.43 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  47.01 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  39.76 
 
 		 172 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  40.27 
 
 		 169 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  41.73 
 
 		 155 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  39.06 
 
 		 193 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  37.41 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  37.82 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  30.22 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  34.72 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  36.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  34.06 
 
 		 158 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  30.23 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  47.78 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  27.69 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  43.48 
 
 		 380 aa  49.3  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  28.67 
 
 		 157 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  30.47 
 
 		 163 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5169  regulatory protein ArsR  29.66 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 380 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 401 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 401 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4467  integrase catalytic region  48.57 
 
 		 466 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  48.44 
 
 		 370 aa  46.2  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 386 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  50 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  40.54 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  47.54 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.94 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  39.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 164 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0368  regulatory protein, ArsR  28.4 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.370147  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  26.11 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  45.71 
 
 		 386 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  38.57 
 
 		 184 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0397  transcriptional regulator, ArsR family  28.4 
 
 		 193 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  40.74 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  26.03 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  47.92 
 
 		 385 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4255  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703282 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4206  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  25.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0893  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4468  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  32.47 
 
 		 153 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3232  integrase catalytic subunit  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.495092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4426  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3406  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 465 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  27.12 
 
 		 152 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 342 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>