More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4329 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  100 
 
 		 320 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  53.16 
 
 		 322 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  53.04 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  52.4 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  53.04 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  51.89 
 
 		 321 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  53.04 
 
 		 315 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  53.04 
 
 		 316 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  52.72 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  52.72 
 
 		 316 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  51.74 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  50.79 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  54.55 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  52.05 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  50 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  49.68 
 
 		 317 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  49.69 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  49.69 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  49.37 
 
 		 321 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  49.68 
 
 		 315 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  49.06 
 
 		 321 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  49.2 
 
 		 321 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  48.9 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  53.29 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  48.09 
 
 		 319 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  47.92 
 
 		 334 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.42 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  46.84 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  47.17 
 
 		 331 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.92 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  49.48 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  45.86 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  46.52 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  46.11 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.25 
 
 		 317 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  45.71 
 
 		 319 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  44.97 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  45.51 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  43.81 
 
 		 318 aa  272  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  41.32 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  43.4 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  42.9 
 
 		 588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  42.77 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.26 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.04 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  41.05 
 
 		 788 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  43.22 
 
 		 784 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.58 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.37 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.88 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  37.74 
 
 		 1070 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  37.94 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  39.47 
 
 		 321 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  40.13 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  38.73 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  39.03 
 
 		 780 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  40.68 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  40.68 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.86 
 
 		 783 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  39.94 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  39.57 
 
 		 323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  36.59 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  39.37 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  39.75 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  39.37 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  39.26 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.23 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  39.43 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  37 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  41.83 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  37.46 
 
 		 326 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.44 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.12 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  35.02 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  35.02 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  37.15 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  39.74 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  37.42 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  41.21 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  41.21 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  41.21 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.24 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  41.21 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  38.8 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  37.81 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  37.81 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  36.79 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  40.89 
 
 		 784 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  40.89 
 
 		 784 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.05 
 
 		 783 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  40.58 
 
 		 784 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  39.24 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  36.25 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  38.05 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  37.12 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  37.62 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  35.2 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>