More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2427 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  87.37 
 
 		 191 aa  333  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  85.26 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  85.26 
 
 		 192 aa  327  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  85.34 
 
 		 191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  83.68 
 
 		 191 aa  323  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  81.77 
 
 		 192 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  84.74 
 
 		 222 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  68.09 
 
 		 193 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  63.3 
 
 		 196 aa  253  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  63.3 
 
 		 196 aa  253  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  63.3 
 
 		 196 aa  253  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  63.49 
 
 		 194 aa  253  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  63.16 
 
 		 198 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  62.23 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  61.7 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  61.7 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  56.61 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  56.61 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  56.61 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  56.61 
 
 		 196 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  56.08 
 
 		 196 aa  234  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  56.08 
 
 		 196 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  56.08 
 
 		 196 aa  234  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  56.08 
 
 		 196 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  56.08 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  48.4 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  49.73 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  50 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  48.33 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  42.55 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  41.36 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  47.06 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  39.25 
 
 		 318 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.54 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  40.86 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  39.25 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  37.16 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  36.61 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  36.61 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  41.85 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  37.06 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.92 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  38.17 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  40.11 
 
 		 219 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  35.71 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  41.85 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.46 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.22 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  37.77 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  37.16 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.3 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  40.1 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  34.91 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  40.1 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  36.07 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  40.64 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  37.5 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.66 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  38.86 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  33.73 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  41.3 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.84 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  33.14 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.91 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  36.41 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  36.84 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  42.86 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  37.16 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  37.1 
 
 		 187 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  39.78 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  32.45 
 
 		 188 aa  104  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  37.43 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  37.91 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  38.46 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.91 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  35.71 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  40.11 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  38.25 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  38.46 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  36.96 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 		 307 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  42.67 
 
 		 307 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  37.16 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  37.97 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  34.27 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.91 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  37.91 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>