More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0805 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 137 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  98.44 
 
 		 128 aa  240  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  92.19 
 
 		 128 aa  228  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  89.84 
 
 		 128 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  89.84 
 
 		 128 aa  224  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  86.76 
 
 		 147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  89.06 
 
 		 128 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  82.81 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  82.81 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  82.81 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  82.81 
 
 		 128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  82.03 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  82.03 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  80.47 
 
 		 128 aa  206  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  59.32 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  58.12 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  52.85 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  55.66 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  56.41 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  46.55 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  50.83 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  54.13 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  53.92 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  52.94 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  51.16 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  52.34 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  46.09 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  46.09 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  46.09 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  50.4 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  52.94 
 
 		 124 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  50.5 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  50.79 
 
 		 154 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  43.97 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  47.37 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  45.54 
 
 		 127 aa  96.7  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  43.1 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  46.28 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.56 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  50.57 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.22 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  40.21 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  49.15 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  45.83 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  39.36 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  60.47 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  44.05 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.29 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.14 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  35.23 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.35 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>