More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3602 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  94.04 
 
 		 285 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  80.42 
 
 		 286 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  80 
 
 		 265 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  80 
 
 		 265 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  80.36 
 
 		 265 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  80.56 
 
 		 288 aa  434  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  58.21 
 
 		 270 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  58.21 
 
 		 270 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  57.25 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  56.99 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  54.51 
 
 		 275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  55.88 
 
 		 277 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  55.51 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  55.88 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  53.73 
 
 		 279 aa  265  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  54.04 
 
 		 285 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  52.79 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  42.48 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  41.45 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  35.23 
 
 		 287 aa  148  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  39.92 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  39.29 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  35.51 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  36.32 
 
 		 280 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  35.95 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 284 aa  131  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  36.86 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  35.32 
 
 		 271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  32.4 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  31.25 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  26.56 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.38 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  27.88 
 
 		 353 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  26.6 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  25.11 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.8 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.02 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.2 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  25.2 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.41 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  37.62 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  37.62 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  26.37 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  22.95 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  37.62 
 
 		 877 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  27.35 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  27.53 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.85 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.44 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7960  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.2 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  22.95 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3302  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  24.28 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  23.53 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.36 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>