41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0010 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  100 
 
 		 660 aa  1325    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  49.24 
 
 		 660 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  29.82 
 
 		 664 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  29.19 
 
 		 658 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  28.02 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  26.35 
 
 		 668 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  25 
 
 		 661 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  24.96 
 
 		 661 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  27.31 
 
 		 660 aa  181  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  26.57 
 
 		 676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  24.75 
 
 		 673 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  24.16 
 
 		 677 aa  163  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 666 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  23.12 
 
 		 663 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  41.98 
 
 		 671 aa  120  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  22.59 
 
 		 671 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  28.99 
 
 		 436 aa  101  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  22.66 
 
 		 657 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  35.33 
 
 		 683 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  31.25 
 
 		 672 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  29.68 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  31.53 
 
 		 663 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  28.32 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  23.88 
 
 		 699 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  19.6 
 
 		 642 aa  54.3  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  24.76 
 
 		 902 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  33.73 
 
 		 395 aa  53.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  29.76 
 
 		 354 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 1018 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  45.76 
 
 		 891 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  39.24 
 
 		 804 aa  47.8  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  38.78 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 1018 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  42 
 
 		 1018 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  42 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  25.51 
 
 		 1020 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1018 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 1018 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  38 
 
 		 1018 aa  44.3  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38 
 
 		 1018 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>