73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1351 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  99.19 
 
 
378 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  98.92 
 
 
378 aa  737    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  100 
 
 
864 aa  1684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  92.98 
 
 
298 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  74.32 
 
 
300 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  74.32 
 
 
293 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  74.32 
 
 
300 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  73.93 
 
 
292 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  73.54 
 
 
292 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  72.87 
 
 
292 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  73.15 
 
 
292 aa  412  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  66.54 
 
 
279 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  60.79 
 
 
298 aa  361  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  59.86 
 
 
298 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  58.06 
 
 
291 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  54.91 
 
 
299 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  46.27 
 
 
288 aa  252  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  32.76 
 
 
285 aa  107  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  29.61 
 
 
282 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  31.17 
 
 
282 aa  99.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  30.71 
 
 
272 aa  92.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  30.67 
 
 
288 aa  90.9  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  29 
 
 
273 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  30.67 
 
 
248 aa  87.8  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  30.67 
 
 
248 aa  87.8  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  27.13 
 
 
274 aa  87  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  28.86 
 
 
266 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  28.14 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.53 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.31 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  31.82 
 
 
259 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  31.4 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  31.06 
 
 
266 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  29.36 
 
 
255 aa  80.5  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  26.97 
 
 
278 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  26.84 
 
 
275 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  31.82 
 
 
248 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  31.82 
 
 
248 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  31.82 
 
 
248 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  29.55 
 
 
288 aa  79  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  31.82 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  28.15 
 
 
248 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  29.05 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
248 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  29.74 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  28.99 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  30.45 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  27.27 
 
 
277 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  27.83 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  29.69 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  30.54 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  30.61 
 
 
275 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  30.12 
 
 
270 aa  69.3  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  28.81 
 
 
268 aa  68.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  25 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  28.03 
 
 
261 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  28.39 
 
 
270 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  22.63 
 
 
282 aa  62  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  29.2 
 
 
270 aa  61.6  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25.84 
 
 
284 aa  61.6  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  26.83 
 
 
259 aa  60.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  25.5 
 
 
259 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  36.78 
 
 
225 aa  58.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  25.53 
 
 
253 aa  55.5  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  25.32 
 
 
261 aa  53.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  26.09 
 
 
263 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  31.82 
 
 
278 aa  49.7  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  33.64 
 
 
273 aa  49.3  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  25.71 
 
 
265 aa  48.5  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  26.38 
 
 
257 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  25.21 
 
 
289 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3367  MltA-interacting MipA  25.86 
 
 
258 aa  45.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.692567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  29.03 
 
 
257 aa  44.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>