More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3437 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  99.36 
 
 
467 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  99.36 
 
 
467 aa  793    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  99.36 
 
 
467 aa  793    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3437  nitrate transporter  100 
 
 
1046 aa  2043    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  96.35 
 
 
606 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  99.36 
 
 
467 aa  793    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  99.79 
 
 
468 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  99.79 
 
 
468 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  76.3 
 
 
455 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  75.62 
 
 
455 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  73.13 
 
 
465 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  38.03 
 
 
403 aa  267  8e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  37 
 
 
404 aa  244  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  36.59 
 
 
403 aa  237  9e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  36.96 
 
 
406 aa  231  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  35.89 
 
 
418 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  33.7 
 
 
439 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  35.43 
 
 
424 aa  211  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  34.62 
 
 
403 aa  208  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 
419 aa  207  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
419 aa  207  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  34.55 
 
 
403 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  34.59 
 
 
403 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  34.19 
 
 
403 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  36.36 
 
 
414 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  31.72 
 
 
433 aa  173  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  27.64 
 
 
389 aa  159  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  27.64 
 
 
389 aa  158  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  27.64 
 
 
389 aa  158  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  44.61 
 
 
404 aa  157  7e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  27.64 
 
 
389 aa  158  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  43.37 
 
 
411 aa  148  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
404 aa  145  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.64 
 
 
389 aa  137  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.64 
 
 
389 aa  137  9e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  39.58 
 
 
403 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  38.07 
 
 
418 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  37 
 
 
403 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  40.59 
 
 
403 aa  134  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
397 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  38 
 
 
403 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  40.54 
 
 
423 aa  133  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  42.69 
 
 
418 aa  133  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  37.18 
 
 
411 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  37.18 
 
 
403 aa  131  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  31.3 
 
 
395 aa  131  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  37.76 
 
 
416 aa  131  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  27.99 
 
 
387 aa  129  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  45.61 
 
 
403 aa  129  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  30.09 
 
 
406 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  41.84 
 
 
412 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  29.86 
 
 
406 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  29.86 
 
 
406 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
403 aa  125  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 
421 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  40.19 
 
 
417 aa  122  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
400 aa  121  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.11 
 
 
421 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.11 
 
 
421 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  28.39 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.35043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  28.5 
 
 
402 aa  114  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 
421 aa  113  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 
428 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  29.24 
 
 
405 aa  112  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  27.07 
 
 
426 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  27.07 
 
 
426 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  28.87 
 
 
417 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  32.44 
 
 
398 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  25.64 
 
 
435 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
435 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  27.07 
 
 
426 aa  109  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  27.57 
 
 
420 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  27.66 
 
 
440 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  26.82 
 
 
436 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
428 aa  105  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
406 aa  105  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  28.21 
 
 
456 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  25.46 
 
 
905 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1345  major facilitator transporter  29.52 
 
 
414 aa  104  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.738653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  28.87 
 
 
455 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
438 aa  102  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 
438 aa  102  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  39.01 
 
 
189 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  26.95 
 
 
418 aa  101  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
438 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  28.03 
 
 
453 aa  99  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.26 
 
 
389 aa  98.6  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  27.25 
 
 
424 aa  98.2  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  25.06 
 
 
441 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  25.89 
 
 
424 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  25.63 
 
 
424 aa  96.3  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  28.64 
 
 
490 aa  95.9  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  28.64 
 
 
490 aa  95.9  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>