More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_4796 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_4796  response regulator  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000140673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4816  response regulator  99.11 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000589569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5198  DNA-binding response regulator  98.67 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5248  DNA-binding response regulator  96.89 
 
 		 225 aa  427  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5235  DNA-binding response regulator  93.18 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0048741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4954  DNA-binding response regulator  95.56 
 
 		 225 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5331  DNA-binding response regulator  95.56 
 
 		 225 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000933212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0006  DNA-binding response regulator  92.89 
 
 		 225 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5227  DNA-binding response regulator  93.33 
 
 		 225 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4919  two component transcriptional regulator  90.22 
 
 		 225 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000171435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  42.99 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  40.27 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  39.21 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 233 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  36.16 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  35.27 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  155  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  37.05 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  42.08 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.65 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.93 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  37.56 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 272 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  35.71 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.84 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  34.08 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  36.64 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.1 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.07 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  35.71 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  38.22 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.07 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  35.53 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 233 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 226 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>