More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2209 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 246 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  99.59 
 
 		 279 aa  484  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  85.6 
 
 		 311 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 254 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  73.36 
 
 		 254 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  72.54 
 
 		 254 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  74.39 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  74.38 
 
 		 253 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 		 253 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  73.97 
 
 		 253 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  65.84 
 
 		 249 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  68.6 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  68.18 
 
 		 252 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  57.49 
 
 		 246 aa  246  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  31.78 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  35.32 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  28.57 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.7 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  28.39 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  28.45 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  28.88 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  29.44 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.44 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  27.05 
 
 		 705 aa  68.6  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.276035  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  27.08 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.28 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  36.52 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.28 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  29.2 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2597  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  29.46 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1596  short chain dehydrogenase  30.05 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.184756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3073  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.69 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.82 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  34.42 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.25 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2711  short chain dehydrogenase  30.73 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.44 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.21 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7589  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  26.41 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>