More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1354 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1343  tRNA-guanine transglycosylase  85.35 
 
 
441 aa  777    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.161378 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1354  Queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
437 aa  905    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0560  queuine tRNA-ribosyltransferase  63.48 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0727  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.28 
 
 
434 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0599  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.77 
 
 
435 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.71 
 
 
402 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal  0.331498 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26670  tRNA-guanine transglycosylase  59.13 
 
 
427 aa  511  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5329  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.36 
 
 
410 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.380877  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4948  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.36 
 
 
410 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5036  queuine tRNA-ribosyltransferase  60.36 
 
 
410 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03090  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.91 
 
 
441 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.576454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5580  queuine tRNA-ribosyltransferase  59.8 
 
 
401 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0411  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.42 
 
 
417 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.37 
 
 
1382 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.08 
 
 
379 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.56 
 
 
379 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.56 
 
 
379 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.54 
 
 
369 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.81 
 
 
372 aa  324  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.69 
 
 
375 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.34 
 
 
394 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.43 
 
 
372 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.78 
 
 
380 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.71 
 
 
372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  41 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.2 
 
 
373 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  40 
 
 
379 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.21 
 
 
370 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.29 
 
 
379 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
380 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.75 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.87 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.87 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.98 
 
 
373 aa  308  9e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.65 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.82 
 
 
392 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  42.11 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1658  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.75 
 
 
405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193813 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.62 
 
 
379 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.77 
 
 
395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.89 
 
 
383 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.27 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.95 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1302  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.67 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.95 
 
 
370 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3728  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.56 
 
 
403 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.79 
 
 
368 aa  302  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.79 
 
 
368 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.41 
 
 
380 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.54 
 
 
357 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.3 
 
 
380 aa  299  7e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.05 
 
 
384 aa  298  9e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.91 
 
 
388 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.05 
 
 
380 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.21 
 
 
373 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.38 
 
 
373 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.11 
 
 
367 aa  297  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.02 
 
 
380 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.44 
 
 
369 aa  295  9e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.54 
 
 
368 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0129  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.06 
 
 
404 aa  295  1e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.18 
 
 
387 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.97 
 
 
368 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.26 
 
 
381 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
395 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.14 
 
 
394 aa  292  8e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1416  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.05 
 
 
367 aa  292  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000679599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
395 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
447 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.24 
 
 
370 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
395 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.36 
 
 
395 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.63 
 
 
378 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.1 
 
 
395 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2201  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.8 
 
 
380 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1912  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.8 
 
 
380 aa  289  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.288264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.95 
 
 
368 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.33 
 
 
404 aa  289  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  40.25 
 
 
371 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  39.84 
 
 
382 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.33 
 
 
396 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  36.9 
 
 
375 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  38.86 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.56 
 
 
384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.58 
 
 
399 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.24 
 
 
371 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.14 
 
 
376 aa  286  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.39 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.79 
 
 
370 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.39 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  39.74 
 
 
379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2804  queuine tRNA-ribosyltransferase  41.11 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>