More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1084 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1084  collagenase  100 
 
 
548 aa  1144    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  52.19 
 
 
406 aa  330  4e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  42.86 
 
 
411 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  49.01 
 
 
409 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1499  peptidase U32  42.98 
 
 
405 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  48.68 
 
 
409 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2291  peptidase U32  50.36 
 
 
426 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  37.56 
 
 
411 aa  307  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  40.49 
 
 
404 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  47.23 
 
 
419 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  46.72 
 
 
408 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  44.98 
 
 
406 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  47.46 
 
 
404 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10820  collagenase-like protease  49.82 
 
 
471 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  49.08 
 
 
430 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  45.99 
 
 
420 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0544  peptidase U32  48.35 
 
 
412 aa  291  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2232  peptidase U32  50.18 
 
 
418 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.83326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  47.25 
 
 
403 aa  287  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  47.25 
 
 
410 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  39.01 
 
 
439 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  39.29 
 
 
412 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  45.82 
 
 
407 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0474  collagenase family protease  45.76 
 
 
411 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  45.39 
 
 
404 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0738  peptidase U32  45.45 
 
 
439 aa  273  6e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  47.97 
 
 
442 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  44.1 
 
 
413 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  48.72 
 
 
406 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1050  putative protease  45.76 
 
 
418 aa  262  8.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.861242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0211  peptidase U32  44.57 
 
 
435 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0480978  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2251  collagenase-like protease  41.35 
 
 
430 aa  260  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  43.22 
 
 
427 aa  258  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0742  U32 family peptidase  44.93 
 
 
428 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.810338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1501  peptidase U32  44.36 
 
 
419 aa  256  7e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4228  peptidase U32  41.67 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4461  peptidase, U32 family  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0735  peptidase, U32 family  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0258645  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4463  U32 family peptidase  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0393784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4514  peptidase, U32 family  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000161437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4277  U32 family peptidase  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4114  U32 family peptidase  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4125  U32 family peptidase  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4609  U32 family peptidase  41.3 
 
 
426 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.856132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4501  peptidase, U32 family  40.94 
 
 
426 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.260528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3094  peptidase U32  41.3 
 
 
426 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.585219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2483  peptidase U32  42.49 
 
 
422 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0969  peptidase U32  42.49 
 
 
422 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1305  U32 family peptidase  42.34 
 
 
417 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0849626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2801  peptidase U32  42.22 
 
 
411 aa  248  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1669  peptidase U32  41.97 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1703  peptidase U32  41.97 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0280  peptidase U32  43.27 
 
 
420 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0411168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0724  U32 family peptidase  42.34 
 
 
417 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000627659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0725  peptidase, U32 family  43.12 
 
 
428 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.737074  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1658  peptidase U32  37.31 
 
 
423 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000440109  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0801  U32 family peptidase  40.85 
 
 
417 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1176  U32 family peptidase  40.15 
 
 
422 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1005  peptidase, U32 family  40.93 
 
 
418 aa  239  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.683549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  41.79 
 
 
783 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2262  U32 family peptidase  41.7 
 
 
414 aa  234  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.734981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0584  U32 family peptidase  36.39 
 
 
438 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2189  peptidase U32  36.98 
 
 
447 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.490075  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1526  peptidase U32  32.84 
 
 
462 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1004  U32 family peptidase  36.36 
 
 
465 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.995229  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1202  U32 family peptidase  36.25 
 
 
463 aa  231  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0162045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1854  peptidase U32  36.06 
 
 
453 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0179  peptidase U32  38.7 
 
 
423 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3025  peptidase U32  34.82 
 
 
471 aa  229  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.360334  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3512  peptidase U32  35.76 
 
 
454 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1864  peptidase U32  43.07 
 
 
430 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.4105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  42.29 
 
 
862 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  38.87 
 
 
872 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3150  peptidase U32  33.17 
 
 
440 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0559462  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0952  peptidase U32  37.41 
 
 
435 aa  227  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3096  U32 family peptidase  35.33 
 
 
464 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00144888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1325  peptidase U32  35.33 
 
 
464 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1208  U32 family peptidase  35.33 
 
 
464 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000479963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1323  collagenase prtC  34.52 
 
 
458 aa  225  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.768171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  42.2 
 
 
847 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0887  peptidase U32  36.58 
 
 
434 aa  225  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0117216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2783  peptidase U32  35.85 
 
 
453 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.582751  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  43.54 
 
 
835 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  33.41 
 
 
810 aa  224  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  40.15 
 
 
886 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1385  peptidase U32  35.35 
 
 
452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.7 
 
 
817 aa  223  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  42.44 
 
 
848 aa  223  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1175  peptidase U32  34.85 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1252  U32 family peptidase  34.85 
 
 
455 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3561  peptidase U32  31.52 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3336  peptidase U32  34.85 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3198  peptidase U32  34.85 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1064  peptidase U32  34.95 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1136  peptidase U32  34.95 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1022  peptidase U32  35.44 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1068  peptidase U32  34.95 
 
 
454 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2214  peptidase U32  33.93 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429025  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1304  peptidase U32  34.28 
 
 
453 aa  221  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3192  peptidase U32  34.55 
 
 
455 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>