79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A1072 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1072  lineage-specific thermal regulator protein  100 
 
 
135 aa  272  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4229  lineage-specific thermal regulator protein  97.78 
 
 
135 aa  265  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000138756  hitchhiker  0.000152407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0943  lineage-specific thermal regulator protein  95.56 
 
 
135 aa  261  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000509541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1132  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  260  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00257594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0965  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  259  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000924855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1111  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  259  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.20777e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1033  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  259  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0954  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  259  6.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.35068e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1203  lineage-specific thermal regulator protein  94.81 
 
 
135 aa  258  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230891  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0954  lineage-specific thermal regulator protein  86.67 
 
 
135 aa  238  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000407363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  38.71 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  37.63 
 
 
115 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  37.63 
 
 
115 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  37.63 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  37.63 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  37.63 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  37.63 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 
123 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
125 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  36.25 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  33.33 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  36.62 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 
115 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  33.78 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  37.68 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 
114 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  26.47 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  32.47 
 
 
106 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 
119 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  26.67 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  26.67 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 
110 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
150 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4803  transcriptional regulator, PadR family  33.87 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1925  PadR-like family transcriptional regulator  31.94 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  26.6 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
268 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1680  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  27.78 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.1 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 
124 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>