More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5571 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5571  putative cytochrome b561  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1941  cytochrome B561  51.11 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.273152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3652  putative cytochrome B561  50.54 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3420  cytochrome b561 family protein  51.09 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00251628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.14 
 
 		 196 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  39.64 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  37.57 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  36.51 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  37.5 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36.46 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1956  cytochrome b561  36.31 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  41.44 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2612  cytochrome B561  40.68 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.81 
 
 		 184 aa  94  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  35.33 
 
 		 183 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  35.87 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  35.71 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  40.88 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  40.88 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  35.52 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1517  cytochrome b561  36.72 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.39069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1819  cytochrome b561  36.72 
 
 		 176 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1306  cytochrome B561  37.08 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1756  cytochrome b561  36.16 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  0.0664837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.52 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  35.33 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.78 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  35.33 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1700  cytochrome b561  36.16 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0149402  hitchhiker  0.00199396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  37.7 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.22 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1759  cytochrome b561  36.16 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.485438  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  36.67 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  40.88 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  35.33 
 
 		 182 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0977  cytochrome B561  36.46 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.92 
 
 		 191 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3348  cytochrome B561  35.03 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.696433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.66 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3894  cytochrome B561  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  31.07 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0490  cytochrome B561  37.28 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370053  hitchhiker  0.00220712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  34.29 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  30.68 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  31.87 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1186  cytochrome B561  36.63 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.592212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3256  cytochrome b561  38.86 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  34.46 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1491  cytochrome b561  31.84 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.336708  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  32.97 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  32.97 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  32.97 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  32.24 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  35.14 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.71 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.8 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0918  cytochrome b561  38.29 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.974416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.7 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3390  cytochrome b561  38.29 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  33.88 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  32.42 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.87 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.97 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5215  cytochrome B561  36.63 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.721049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  35.87 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  31.89 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  33.33 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  30.17 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5072  cytochrome b561, putative  35.87 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2184  putative cytochrome B561  32.29 
 
 		 400 aa  77.8  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  30.41 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  32.4 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  30.41 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4170  cytochrome B561  34.08 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  32.24 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03240  cytochrome b561  38.92 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.52 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.96 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  32.6 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  32.97 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  33.15 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  32.77 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1736  cytochrome B561  35.09 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0874237  normal  0.949544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0199  cytochrome B561 cytochrome transmembrane protein  31.52 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.313091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1755  cytochrome b561  36.16 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000553481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  29.05 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2205  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.58 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.202008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  32.58 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  31.52 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  32.58 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  30.11 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  31.52 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  31.52 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4671  cytochrome B561  31.64 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.098632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>