More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5141 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5141  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
386 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237581  normal  0.0395804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4409  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
417 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417322  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
379 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4699  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
380 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2455  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.19 
 
 
392 aa  306  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05234  Fe-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06800)  31.87 
 
 
414 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.868028  normal  0.105972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1051  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6463  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.16 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2957  methanol dehydrogenase, NAD-dependent  30.66 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0476972  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4611  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557195  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2742  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.51 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0794554  normal  0.0588178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2082  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4891  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
356 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.592699  normal  0.0411098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.27 
 
 
389 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4129  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
357 aa  126  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1786  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
388 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2394  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.62 
 
 
389 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.88 
 
 
382 aa  126  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5062  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
352 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  31.43 
 
 
386 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.66 
 
 
381 aa  123  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.50517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  31.88 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  25.37 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  25.37 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.68 
 
 
383 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
382 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3674  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  27.23 
 
 
887 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.95 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2942  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204686  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5623  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0837  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0202  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.58 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.34 
 
 
383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2344  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
432 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4085  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.47 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0871083  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.38 
 
 
383 aa  116  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.81 
 
 
368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3432  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.2 
 
 
355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.72 
 
 
382 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2103  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0158602  normal  0.562089 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5063  maleylacetate reductase  27.72 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0529248  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5476  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.33 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377553  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.33 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5215  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.3 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.72 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0986  putative NAD-dependent 4-hyddoxybutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  29.31 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  26.53 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6071  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.49 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  26.72 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.69 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1060  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.01 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.126321  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  26.72 
 
 
382 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 
887 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.72 
 
 
383 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.72 
 
 
383 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1868  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
394 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.72 
 
 
382 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.75 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0063  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3465  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.05 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117346  normal  0.139258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  27.01 
 
 
382 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5727  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 
352 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0177  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
383 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000105782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  27.6 
 
 
385 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  27.6 
 
 
385 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3377  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 
355 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 
382 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
386 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  27.74 
 
 
387 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.54 
 
 
384 aa  112  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  23.86 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.65 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2317  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.735115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1395  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.22 
 
 
383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2043  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 
858 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.6 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409479  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.23 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1055  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.46 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0991  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.99 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2530  alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  28.67 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.11 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.42 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  25.59 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.28 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.5 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5309  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.07 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.203818  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05178  maleylacetate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07090)  24.87 
 
 
357 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.516162  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4574  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
354 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.807648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.46 
 
 
382 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3335  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.37 
 
 
358 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.330592  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  25.57 
 
 
395 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>