More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3889 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  100 
 
 
426 aa  885    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  83.57 
 
 
426 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  83.8 
 
 
426 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  81.67 
 
 
424 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  84.27 
 
 
426 aa  759    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  47.64 
 
 
436 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  48.58 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  47.88 
 
 
427 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  48.58 
 
 
430 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  50.94 
 
 
427 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  47.38 
 
 
432 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  45.88 
 
 
427 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  45.58 
 
 
432 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  45.52 
 
 
432 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  45.35 
 
 
432 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.45 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.6 
 
 
431 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.81 
 
 
447 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.88 
 
 
437 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  34.29 
 
 
446 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.56 
 
 
453 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.95 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.67 
 
 
413 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  32.86 
 
 
422 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.96 
 
 
429 aa  210  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  31.12 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  32.38 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.98 
 
 
433 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 
422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  31.67 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 
422 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  31.43 
 
 
422 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.98 
 
 
441 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.35 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.04 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2920  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.53 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  32.63 
 
 
418 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.48 
 
 
428 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.44 
 
 
447 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.2 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.14 
 
 
437 aa  168  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.64 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
424 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.7 
 
 
463 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4506  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 
428 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 
417 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.22 
 
 
422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 
424 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  29.47 
 
 
433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  27.17 
 
 
426 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  27.17 
 
 
426 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.15 
 
 
441 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
424 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  26.35 
 
 
424 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  26.61 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  26.94 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  28 
 
 
424 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
433 aa  139  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
424 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  31.93 
 
 
425 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  26.09 
 
 
418 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.7 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.39 
 
 
387 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  30.17 
 
 
753 aa  112  9e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  26.96 
 
 
393 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  32.26 
 
 
389 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.56 
 
 
413 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.15 
 
 
416 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.72 
 
 
410 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  27.85 
 
 
434 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.06 
 
 
400 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.62 
 
 
399 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  29.43 
 
 
406 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 
412 aa  103  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  34.6 
 
 
411 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  30.04 
 
 
404 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  32.26 
 
 
387 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 
398 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  30.12 
 
 
406 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.36 
 
 
391 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  29.64 
 
 
406 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  29.82 
 
 
406 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 
405 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  33.02 
 
 
388 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.88 
 
 
397 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.18 
 
 
386 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.718454  normal  0.0448181 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 
398 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  33.98 
 
 
397 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 
383 aa  100  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.07 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2469  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.23 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000634543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 
386 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 
395 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>