145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1288 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1288  putative Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase  100 
 
 		 163 aa  301  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0693178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0731  peptidase A24A, prepilin type IV  49.3 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.465055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4646  peptidase, A24 (type IV prepilin peptidase) family  35.29 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000049764  normal  0.0336249 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  35.29 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3012  peptidase A24A, prepilin type IV  36.59 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  36.36 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  37.21 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  35.48 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  41.11 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  34.68 
 
 		 283 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.69 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  36.64 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  36.64 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  36.64 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.61 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0807  peptidase A24A prepilin type IV  34.38 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3711  leader peptidase HopD  33.87 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00474586  normal  0.728501 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3638  leader peptidase HopD  33.87 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000886735  normal  0.214059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  34.72 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  37.63 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  35.61 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0392  peptidase A24A, prepilin type IV  35.37 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.354362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.04 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.04 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  35.11 
 
 		 303 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  35.11 
 
 		 303 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  35.48 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  35.48 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  34.48 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  34.85 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  30.71 
 
 		 304 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2122  peptidase A24A domain-containing protein  44.29 
 
 		 255 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.711302  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  36.56 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  35.07 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  34.4 
 
 		 309 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.37 
 
 		 297 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.03 
 
 		 300 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3809  type III leader peptidase  33.06 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00060894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  32.79 
 
 		 291 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3638  type III leader peptidase  33.06 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3746  type III leader peptidase  33.06 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00764822  normal  0.0487267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  38 
 
 		 288 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  30 
 
 		 304 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  29.75 
 
 		 289 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  32.82 
 
 		 318 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  30 
 
 		 308 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2409  Prepilin peptidase  36 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0391481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  30 
 
 		 308 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.68 
 
 		 285 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3529  type 4 prepilin peptidase  34.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.645409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02841  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  34.59 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03186  bifunctional prepilin leader peptidase/ methylase  34.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0378  peptidase A24A prepilin type IV  34.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.09 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03137  hypothetical protein  34.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  34.59 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  34.56 
 
 		 288 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02791  hypothetical protein  34.59 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000841079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  28.37 
 
 		 277 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  28.37 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  28.37 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0378  peptidase A24A prepilin type IV  34.68 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.735955 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0724  Acid phosphatase  34.59 
 
 		 269 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  34.56 
 
 		 288 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  38.75 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  33.33 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  35.11 
 
 		 289 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  33.61 
 
 		 294 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  35 
 
 		 288 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  34.69 
 
 		 261 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.76 
 
 		 280 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  28.47 
 
 		 295 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  36.99 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3430  type IV prepilin peptidase family protein  33.83 
 
 		 269 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0773  prepilin peptidase  34.41 
 
 		 289 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  37.5 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3250  leader peptidase PppA  33.83 
 
 		 269 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  28.68 
 
 		 303 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  26.56 
 
 		 239 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3141  type IV prepilin peptidase family protein  33.83 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  31.25 
 
 		 303 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  33.68 
 
 		 282 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.27 
 
 		 298 aa  47.4  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2305  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.94 
 
 		 262 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  33.72 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  32.38 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.29 
 
 		 299 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2023  peptidase A24A prepilin type IV  40 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.674967  normal  0.217892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  32.12 
 
 		 351 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.85 
 
 		 351 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  28.23 
 
 		 289 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  32.12 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  29.27 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  31.68 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>