266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  753    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  39.89 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4826  Patatin  39.32 
 
 
356 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5104  Patatin  37.88 
 
 
341 aa  222  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0159  Patatin  38.19 
 
 
358 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5038  Patatin  37.57 
 
 
341 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0708039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4578  patatin  37.29 
 
 
341 aa  216  7e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.248234 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  39.27 
 
 
384 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  34.71 
 
 
389 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  36.39 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  34.39 
 
 
410 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  38.37 
 
 
390 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  36.75 
 
 
379 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  34.39 
 
 
387 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3555  patatin  36.63 
 
 
384 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  35.92 
 
 
378 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  35.07 
 
 
418 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  36.28 
 
 
387 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  32.29 
 
 
412 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0496  patatin  35.36 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  32.58 
 
 
390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  33.53 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  31.92 
 
 
390 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5766  Patatin-like phospholipase domain-containing protein  33.91 
 
 
378 aa  179  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  31.92 
 
 
412 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  34.01 
 
 
387 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  34.19 
 
 
390 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  33.14 
 
 
405 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  32.11 
 
 
400 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  32.67 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  31.22 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  32.67 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  32.67 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  31.62 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  31.58 
 
 
427 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  32.39 
 
 
405 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  32.39 
 
 
405 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6972  putative patatin-like phospholipase  35.65 
 
 
391 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  35.35 
 
 
386 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  31.83 
 
 
420 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  31.83 
 
 
420 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  31.67 
 
 
417 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  33.15 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4003  patatin  36.95 
 
 
385 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.426633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  30.62 
 
 
442 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  33.9 
 
 
399 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  29.38 
 
 
417 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  30.88 
 
 
371 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  30.88 
 
 
371 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  33.63 
 
 
374 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  32.28 
 
 
385 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  31.52 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  30.29 
 
 
379 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  30.88 
 
 
377 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  30.97 
 
 
429 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  31.34 
 
 
379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.1 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2265  hypothetical protein  29.25 
 
 
386 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  31.03 
 
 
379 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.03 
 
 
379 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2237  hypothetical protein  28.97 
 
 
386 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1412  putative patatin-like phospholipase  32.24 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3431  patatin  31.59 
 
 
394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.19 
 
 
765 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.8 
 
 
763 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  30.06 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.79 
 
 
777 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
757 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.86 
 
 
757 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.86 
 
 
757 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.86 
 
 
757 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.86 
 
 
757 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.86 
 
 
757 aa  90.1  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.86 
 
 
757 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  24.34 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.09 
 
 
757 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  24.23 
 
 
339 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  29.81 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.75 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  28.04 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  29.86 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  26.91 
 
 
357 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  29.86 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  28.5 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.68 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  30.64 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  27.49 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  30.99 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  30.99 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  29.82 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  28.01 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  24.14 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.69 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  27.97 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  29.26 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>