123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8099 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  100 
 
 		 308 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  73.05 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  65.26 
 
 		 308 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  68.18 
 
 		 308 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  67.53 
 
 		 308 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  66.56 
 
 		 308 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  64.94 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  63.19 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  62.54 
 
 		 306 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  62.87 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  63.19 
 
 		 306 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  69.87 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  55.67 
 
 		 299 aa  338  8e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  55.37 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  54.15 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  54.42 
 
 		 301 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  52.32 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  50.17 
 
 		 362 aa  291  7e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  55.83 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  45.89 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  45.97 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  45.86 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  44.52 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  48.01 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  43.21 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  44.15 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  40.07 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  43.58 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  41 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  41.22 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  44.85 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  43.67 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  40.66 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  42.34 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  40.33 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  41.55 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  40.71 
 
 		 320 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  42.86 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.3 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  42.16 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  42.16 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  40.59 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  41.81 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  40.86 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  40.76 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  42.31 
 
 		 434 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  39.43 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  39.87 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  40.82 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  40.82 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  39.55 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  39.55 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  40.53 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  39.16 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  38.34 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  39.81 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  38.82 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  43.13 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  41.2 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  38.14 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  39.93 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  40 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  42.67 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  36.78 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  36.49 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  36.67 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  39.13 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  48.12 
 
 		 325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  39.53 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  41.44 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  56.21 
 
 		 184 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.77 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  37.01 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  40.48 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  35.29 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  35.29 
 
 		 986 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  33.87 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  34.26 
 
 		 344 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  33.94 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  35.33 
 
 		 410 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  41.58 
 
 		 260 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  39.75 
 
 		 248 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  35.62 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1580 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  33.56 
 
 		 1448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  30.7 
 
 		 384 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  33.1 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  32.23 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.22 
 
 		 1077 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  30.17 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  33.89 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  33.23 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1495 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  39.35 
 
 		 258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  32.62 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.64 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.93 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1298  antirestriction protein-like  46.3 
 
 		 199 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.430791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>