More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7309 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  36.99 
 
 		 3130 aa  840    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 2226 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  43.86 
 
 		 1302 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  39.23 
 
 		 1911 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  37.73 
 
 		 3090 aa  818    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.79 
 
 		 2316 aa  704    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  42.45 
 
 		 4186 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  44.56 
 
 		 1424 aa  731    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  45.85 
 
 		 2498 aa  703    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  43.23 
 
 		 1646 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  40.94 
 
 		 2176 aa  659    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 		 4646 aa  846    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 995 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  32.2 
 
 		 1612 aa  723    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  38.14 
 
 		 1574 aa  908    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  32.33 
 
 		 1612 aa  725    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  37.86 
 
 		 3093 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  35.49 
 
 		 1833 aa  794    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  45.09 
 
 		 2454 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  38.48 
 
 		 1795 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 		 2273 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  42.86 
 
 		 1488 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  38.36 
 
 		 1520 aa  829    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  35.58 
 
 		 2150 aa  707    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  41.49 
 
 		 995 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  41.72 
 
 		 2710 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  35.57 
 
 		 2243 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  35.24 
 
 		 4647 aa  740    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  36.92 
 
 		 1582 aa  877    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  42.22 
 
 		 2679 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 		 1909 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.56 
 
 		 2684 aa  690    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 		 1416 aa  683    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  38.08 
 
 		 1653 aa  874    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  38.83 
 
 		 1466 aa  838    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  37.93 
 
 		 1535 aa  777    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  37.35 
 
 		 1560 aa  750    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  38.9 
 
 		 1408 aa  686    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  43.83 
 
 		 2682 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  38.37 
 
 		 3089 aa  862    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  100 
 
 		 1486 aa  2988    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  37.23 
 
 		 3108 aa  811    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  34.59 
 
 		 2093 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  43.92 
 
 		 4265 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  43.92 
 
 		 4239 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  43.79 
 
 		 4265 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  41.41 
 
 		 1470 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.89 
 
 		 1489 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  41.92 
 
 		 3335 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  41.83 
 
 		 974 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 		 1472 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  33.84 
 
 		 1497 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  40.6 
 
 		 1472 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  40.71 
 
 		 1472 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.02 
 
 		 3133 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.38 
 
 		 2604 aa  609  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.02 
 
 		 3127 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 		 2762 aa  599  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.92 
 
 		 6889 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 2551 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  41.14 
 
 		 1466 aa  589  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.37 
 
 		 1656 aa  567  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  37.96 
 
 		 3194 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 		 1587 aa  562  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  36.07 
 
 		 1087 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  40.47 
 
 		 1524 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  36.38 
 
 		 2551 aa  556  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  41.3 
 
 		 1530 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  40.95 
 
 		 1530 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.36 
 
 		 2462 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  40.93 
 
 		 1528 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.71 
 
 		 1337 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.18 
 
 		 1559 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 		 3696 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 1559 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 1874 aa  533  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  32.99 
 
 		 3427 aa  533  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.07 
 
 		 950 aa  520  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 		 3702 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 3693 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.58 
 
 		 1354 aa  515  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 		 3693 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.52 
 
 		 3676 aa  513  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.16 
 
 		 1101 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.99 
 
 		 1349 aa  509  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  36.32 
 
 		 3163 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.96 
 
 		 3337 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.07 
 
 		 1349 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.32 
 
 		 3176 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.71 
 
 		 4478 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.3 
 
 		 3099 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.54 
 
 		 3679 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  38.68 
 
 		 1465 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  36.81 
 
 		 3275 aa  498  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  37.81 
 
 		 3424 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  33.9 
 
 		 2024 aa  495  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  37.98 
 
 		 3173 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  38.75 
 
 		 3645 aa  486  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.56 
 
 		 4080 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 5400 aa  486  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>